RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216416.8

CNIH1-201, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNIH1, Length 4,793 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH1-201ENST00000216416 SAP18O00422 153 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 AREL1O15033 823 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 BIRC5O15392 142 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 TAPBPO15533 448 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 SMIM24O75264 130 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 HNF4AP41235 474 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 NSG1P42857 185 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 PRKAA2P54646 552 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 PAOXQ6QHF9 649 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 TSSK4Q6SA08 328 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 ZBTB2Q8N680 514 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF740Q8NDX6 193 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 IPPKQ9H8X2 491 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 DZANK1Q9NVP4 752 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 PKD2L2Q9NZM6 624 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 TECTAO75443 2155 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 ALPK2Q86TB3 2170 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 H7C0S8 307 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 HDAC3O15379 428 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 SLC16A8O95907 504 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 C1QCP02747 245 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 PRNPP04156 253 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 RBP1P09455 135 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 TPBGLP0DKB5 382 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 CBLBQ13191 982 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 ITIH4Q14624 930 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 PTCHD3Q3KNS1 767 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 CCDC91Q7Z6B0 441 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 SNX32Q86XE0 403 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 DEFB123Q8N688 67 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 KCNV2Q8TDN2 545 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 UCMAQ8WVF2 138 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 BTN2A2Q8WVV5 523 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 KIAA1191Q96A73 305 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 VPS33AQ96AX1 596 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 EBF2Q9HAK2 575 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 SYTL2Q9HCH5 934 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 SLC40A1Q9NP59 571 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 KLQ9UEF7 1012 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 PDE10AQ9Y233 779 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 SHISA7A6NL88 538 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 POP7O75817 140 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 UNC5CO95185 931 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 ASPHQ12797 758 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 AGBL4Q5VU57 503 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 LONP2Q86WA8 852 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 SHISA5Q8N114 240 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 MYO1HQ8N1T3 1032 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 METTL6Q8TCB7 284 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 CXorf40AQ8TE69 158 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 WDR60Q8WVS4 1066 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 NUS1Q96E22 293 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 SIPA1Q96FS4 1042 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 SLC2A11Q9BYW1 496 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 MKS1Q9NXB0 559 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 RAP2CQ9Y3L5 183 aa6.45□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 A0A0G2JN53 185 aa6.44□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 LOC730098B7Z3J9 87 aa6.44□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 SDHDO14521 159 aa6.44□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 MAP3K13O43283 966 aa6.44□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 LRATO95237 230 aa6.44□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 DCNP07585 359 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 FOSL2P15408 326 aa6.44□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 NDUFV2P19404 249 aa6.44□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 IMPDH1P20839 514 aa6.44□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 GRK2P25098 689 aa6.44□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 PSMB5P28074 263 aa6.44□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 MAPK8P45983 427 aa6.44□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 COPAP53621 1224 aa6.44□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 C1orf61Q13536 156 aa6.44□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 NAE1Q13564 534 aa6.44□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 CUL3Q13618 768 aa6.44□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 ISLR2Q6UXK2 745 aa6.44□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 ARMCX6Q7L4S7 300 aa6.44□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 PACS2Q86VP3 889 aa6.44□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 OR4F6Q8NGB9 312 aa6.44□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 OR2T11Q8NH01 316 aa6.44□□□□□ -1.38
CNIH1-201ENST00000216416 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms