RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000065304.11

Rtn3-202, Transcript of Reticulon-3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Rtn3, Length 5,030 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Mup4P11590 178 aa11.13□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Defa11P50709 85 aa11.13□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Rit1P70426 219 aa11.13□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Taf1aP97357 453 aa11.13□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Gm8773Q3UQ24 132 aa11.13□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Ubtfl1Q3USZ2 394 aa11.13□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Mars2Q499X9 586 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 G2e3Q5RJY2 716 aa11.13□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Taf6Q62311 678 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Commd7Q8BG94 200 aa11.13□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Serpinb9dQ8BMT0 377 aa11.13□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Gpr61Q8C010 449 aa11.13□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Faim2Q8K097 317 aa11.13□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Sh3d19Q91X43 789 aa11.13□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 VapbQ9QY76 243 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Adgrl2Q8JZZ7 1487 aa11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 GabreA2AMW3 916 aa11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Gm4307E9PZY4 289 aa11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Fgl2P12804 432 aa11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 CebpgP53568 150 aa11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Hdac2P70288 488 aa11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 TankP70347 448 aa11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 BcheQ03311 603 aa11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Yes1Q04736 541 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Tgm3Q08189 693 aa11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Slc9b2Q5BKR2 547 aa11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Brsk1Q5RJI5 778 aa11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Abcg1Q64343 666 aa11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 AasdhQ80WC9 1100 aa11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 NarsQ8BP47 559 aa11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Ints5Q8CHT3 1018 aa11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Atat1Q8K341 421 aa11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Tmem185bQ8R3R5 350 aa11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Lmcd1Q8VEE1 365 aa11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Olfr45Q8VGM1 311 aa11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Capns2Q9D7J7 247 aa11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 RbmxQ9WV02 391 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Slc26a3Q9WVC8 757 aa11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 CpdO89001 1377 aa11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 A0A286YDM2 672 aa11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Sppl2cA2A6C4 690 aa11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Tex13aA2AFS9 377 aa11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Zfp105G3X9I0 524 aa11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Cbx4O55187 551 aa11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 CatP24270 527 aa11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 PpibP24369 216 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Acvr2bP27040 536 aa11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Dlg3P70175 849 aa11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 EpycP70186 322 aa11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Prr7Q3V0I2 269 aa11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Zbtb2Q3V3W4 514 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 MarcoQ60754 518 aa11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Bcar1Q61140 874 aa11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 FaddQ61160 205 aa11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Ube2r2Q6ZWZ2 238 aa11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Stk17bQ8BG48 372 aa11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Itih5Q8BJD1 952 aa11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Aifm2Q8BUE4 373 aa11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Wdr59Q8C0M0 992 aa11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Acad10Q8K370 1069 aa11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Kcnq3Q8K3F6 873 aa11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Sbk1Q8QZX0 417 aa11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Cts3Q91ZD5 332 aa11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Ankrd61Q9CQM6 421 aa11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Gm16286Q9CQX6 220 aa11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 PmpcaQ9DC61 524 aa11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 AgkQ9ESW4 421 aa11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Maged1Q9QYH6 775 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Cfap74Q3UY96 1578 aa11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Ttc39aA2ACP1 578 aa11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Vmn2r34E9PVI0 852 aa11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Vmn2r41E9Q5C7 852 aa11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Vmn2r40F6W043 852 aa11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Vmn2r37F8VQD3 802 aa11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Dbx2F8VQH7 377 aa11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Vmn2r36K7N741 852 aa11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 GzmgP13366 248 aa11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Cyp2a5P20852 494 aa11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 AboP38649 332 aa11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 SqleP52019 572 aa11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Atp5a1Q03265 553 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Slc44a5Q5RJI2 710 aa11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Znf512Q69Z99 562 aa11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Naaladl1Q7M758 745 aa11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Olfr26Q7TRB7 308 aa11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Prdm4Q80V63 803 aa11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Pramel7Q810Y8 479 aa11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Zc3hav1lQ8BFR1 296 aa11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Trmt10aQ8C1Z8 328 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Angel2Q8K1C0 544 aa11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Gspt1Q8R050 636 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Mrpl45Q9D0Q7 306 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Olfr933Q9EQA0 308 aa11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Kat2aQ9JHD2 830 aa11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Cyp4a14O35728 507 aa11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Il13ra2O88786 383 aa11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Apba3O88888 571 aa11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Mxd1P50538 227 aa11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Rps12P63323 132 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
Rtn3-202ENSMUST00000065304 Cdk2P97377 346 aa11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 43 ms