RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000042824.12

Herc1-201, Transcript of HECT and RLD domain-containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Herc1, Length 15,153 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc1-201ENSMUST00000042824 Spin4Q8K1L2 249 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gsto2Q8K2Q2 248 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Zfp940Q8R2Q3 566 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Sgsm3Q8VCZ6 750 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Slc6a20aQ8VDB9 592 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Cyp2j9Q924D1 502 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gm16286Q9CQX6 220 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Chchd3Q9CRB9 227 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Batf3Q9D275 118 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Ninj2Q9JL89 143 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Tead4Q62296 427 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Bcas3Q8CCN5 928 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Coq9Q8K1Z0 313 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Il17cQ8K4C5 194 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Grhl1Q921D9 618 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Pih1d1Q9CQJ2 290 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Rnf186Q9D241 226 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Msgn1Q9JK54 188 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 VarsQ9Z1Q9 1263 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gm45713A0A1B0GS68 446 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Bclaf3A2AG58 752 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gm7535F7CXE4 302 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Cab39Q06138 341 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Sec31bQ3TZ89 1158 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 CcnhQ61458 323 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Q8BHB7 409 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Fam46bQ8C152 427 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Cfap61Q8CEL2 1252 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Tmcc3Q8R310 477 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 AmacrO09174 381 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Znf583Q3V080 568 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Luzp2Q8BGY3 345 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Znf410Q8BKX7 478 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Plekhs1Q8BW88 474 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Fam192aQ91WE2 254 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Necab2Q91ZP9 389 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Mpp2Q9WV34 552 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 TomtA1Y9I9 258 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 GmlE9PX31 176 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 S100a6P14069 89 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 SgcgP82348 291 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 QrfprP83861 433 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Syndig1lQ3USQ7 237 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Fam71dD3YV92 440 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Olfr596F8VQ26 312 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Vmn2r102L7N279 857 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Per3O70361 1113 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Hipk1O88904 1210 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Mc1rQ01727 315 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Fam169aQ5XG69 665 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Adora2bQ60614 332 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Slc39a13Q8BZH0 361 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Rnf222Q8CEF8 211 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Tdrd12Q9CWU0 1215 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Bpifa3Q9D9J8 232 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Cyp4f14Q9EP75 524 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Hipk3Q9ERH7 1192 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Cldn9Q9Z0S7 217 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Zdbf2Q5SS00 2493 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gm7945F6QI24 236 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Slc6a6O35316 621 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Alox5P48999 674 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Apoa1Q00623 264 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Hmgcll1Q8JZS7 343 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Cops8Q8VBV7 209 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 L2hgdhQ91YP0 464 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Slco1a1Q9QXZ6 670 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Scn9aQ62205 1984 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Prl4a1O35256 227 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 CidebO70303 219 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Kcnj9P48543 393 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gstt2Q61133 244 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Rab36Q8CAM5 267 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Ptdss1Q99LH2 473 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 TympQ99N42 471 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Exo5Q9CXP9 373 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 PlgrktQ9D3P8 147 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Slc39a5Q9D856 535 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Olfr2Q9QWU6 327 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 ChadO55226 358 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Ccnd1P25322 295 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Psmd7P26516 321 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Polr3bP59470 1133 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Upf3aQ3ULJ3 422 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 TbceQ8CIV8 524 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Otud4B2RRE7 1107 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Ptch2O35595 1182 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Rc3h2P0C090 1187 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Rhox5P52651 210 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Tmprss15P97435 1069 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Pdcd1Q02242 288 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Tspan9Q8BJU2 239 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Adgrl4Q923X1 739 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Rbm18Q9CR83 190 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 SvilQ8K4L3 2170 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Rad21l1A2AU37 552 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Tulp3O88413 460 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Cntn5P68500 1098 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 Fmo3P97501 534 aa5.77□□□□□ -1.49
Herc1-201ENSMUST00000042824 F8a1Q00558 380 aa5.77□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 23.6 ms