RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027404.11

Ptprn-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptprn, Length 3,554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Znf106O88466 1888 aa15.84■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Chil5A0A0G2JDS2 431 aa15.84■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr1153A2AVC0 318 aa15.84■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Eif2b3B1AUN2 452 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn2r50E9PW61 861 aa15.84■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Spdye4cI6XKQ3 339 aa15.84■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sstr4P49660 385 aa15.84■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Polr3bP59470 1133 aa15.84■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zmym5Q3U2E2 627 aa15.84■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lingo3Q6GQU6 589 aa15.84■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fam221bQ8C627 487 aa15.84■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Q8CDN1 933 aa15.84■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sbk1Q8QZX0 417 aa15.84■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lmcd1Q8VEE1 365 aa15.84■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pqbp1Q91VJ5 263 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Atp13a2Q9CTG6 1169 aa15.84■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pinx1Q9CZX5 332 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Btbd35f28A2CFD5 498 aa15.84■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zfp780bE9Q2S6 806 aa15.84■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Btbd35f30J3QML3 498 aa15.84■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn2r54K7N649 806 aa15.84■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn2r31L7N1Z4 861 aa15.84■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 StacP97306 403 aa15.84■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zfp607aQ3TQG9 686 aa15.84■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hk3Q3TRM8 922 aa15.84■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Trmt10cQ3UFY8 414 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cldn11Q60771 207 aa15.84■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Trpc1Q61056 793 aa15.84■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kcna5Q61762 602 aa15.84■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tead4Q62296 427 aa15.84■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tatdn1Q6P8M1 295 aa15.84■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Defb34Q7TNV8 81 aa15.84■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gpr142Q7TQN9 365 aa15.84■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 HnrnplQ8R081 586 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr695Q8VFM3 315 aa15.84■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Marc2Q922Q1 338 aa15.84■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Aco2Q99KI0 780 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 AasdhpptQ9CQF6 309 aa15.84■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Themis3Q9CU24 569 aa15.84■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Exoc2Q9D4H1 924 aa15.84■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rpl38Q9JJI8 70 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rad18Q9QXK2 509 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 A0A1L1ST33 502 aa15.83■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lcn5A2AJB7 192 aa15.83■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rhox3cA2AWM0 215 aa15.83■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc28a1E9PXX9 648 aa15.83■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nsmce4aG3XA30 381 aa15.83■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rhox3hL7MU37 215 aa15.83■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Man2b1O09159 1013 aa15.83■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pxmp2P42925 194 aa15.83■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Q3UK37 420 aa15.83■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rhox3aQ4TU90 215 aa15.83■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pik3r3Q64143 461 aa15.83■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mgat5bQ765H6 792 aa15.83■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 B3gnt5Q8BGY6 376 aa15.83■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pik3cbQ8BTI9 1064 aa15.83■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lrch3Q8BVU0 778 aa15.83■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gk5Q8BX05 534 aa15.83■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Barhl2Q8VIB5 384 aa15.83■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 TrmuQ9DAT5 417 aa15.83■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cacng3Q9JJV5 315 aa15.83■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc6a14Q9JMA9 638 aa15.83■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Epb41l4bQ9JMC8 527 aa15.83■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zbtb18Q9WUK6 522 aa15.83■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm6811E9Q3Y8 510 aa15.83■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 RfngO09009 332 aa15.83■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fgf10O35565 209 aa15.83■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 F3P20352 294 aa15.83■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Csrp3P50462 194 aa15.83■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pou1f1Q00286 291 aa15.83■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mapre1Q61166 268 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mvb12bQ6KAU4 317 aa15.83■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ip6k1Q6PD10 433 aa15.83■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 1700020N01RikQ8CF20 87 aa15.83■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pitrm1Q8K411 1036 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nae1Q8VBW6 534 aa15.83■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vps4aQ8VEJ9 437 aa15.83■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr806Q8VFI2 313 aa15.83■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sdcbp2Q99JZ0 292 aa15.83■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Det1Q9D0A0 550 aa15.83■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hcar2Q9EP66 360 aa15.83■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 IkbkeQ9R0T8 717 aa15.83■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zfp938E9Q9G3 579 aa15.82■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn2r86G5E8Y4 848 aa15.82■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Bcl7cO08664 217 aa15.82■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kifc3O35231 824 aa15.82■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 BegainQ68EF6 600 aa15.82■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc25a23Q6GQS1 467 aa15.82■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tas2r131Q7M708 310 aa15.82■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr834Q7TRG8 312 aa15.82■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vrk2Q8BN21 503 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tigd4Q8BUZ3 513 aa15.82■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Actr8Q8R2S9 624 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 AcmsdQ8R519 336 aa15.82■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pcdhb21Q91V48 774 aa15.82■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 BlvraQ9CY64 295 aa15.82■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rnf146Q9CZW6 359 aa15.82■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gbe1Q9D6Y9 702 aa15.82■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Trim39Q9ESN2 488 aa15.82■□□□□ 0.12
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pin1Q9QUR7 165 aa15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 82 ms