RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000624145.3

ANKRD28-215, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ANKRD28, Length 6,383 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-215ENST00000624145 GLI1P08151 1106 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 ITGA5P08648 1049 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 ANXA3P12429 323 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 PEPDP12955 493 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 CXCR1P25024 350 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 RPL22P35268 128 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 MAGEA6P43360 314 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 HCAR3P49019 387 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 SLC20A2Q08357 652 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 MERTKQ12866 999 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 HSPB3Q12988 150 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 NAE1Q13564 534 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 ITGA7Q13683 1181 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 GLYATQ6IB77 296 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 USP43Q70EL4 1123 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 SIRT2Q8IXJ6 389 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 UBE2J2Q8N2K1 259 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 KLHL36Q8N4N3 616 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 PROKR2Q8NFJ6 384 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 OR5T2Q8NGG2 359 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 OR14C36Q8NHC7 312 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 CERKQ8TCT0 537 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 LCN9Q8WX39 176 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 GAD1Q99259 594 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 PCBD2Q9H0N5 130 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 TOR3AQ9H497 397 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 TMEM184CQ9NVA4 438 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 TBC1D14Q9P2M4 693 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 KCNN3Q9UGI6 736 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 PACSIN3Q9UKS6 424 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 WASF2Q9Y6W5 498 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 UGGT1Q9NYU2 1555 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 MYPNQ86TC9 1320 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 PRORSD1PA6NEY8 169 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 NPIPA5E9PKD4 350 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 FFAR2O15552 330 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 OR1F1O43749 312 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 DNAJA2O60884 412 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 CLDN9O95484 217 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 SLC16A8O95907 504 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 PRNPP04156 253 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP3.99□□□□□ -1.772e-9■■■■□ 25.2
ANKRD28-215ENST00000624145 EPCAMP16422 314 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 IL7RP16871 459 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 ADORA2AP29274 412 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 CD40LGP29965 261 aa3.99□□□□□ -1.77
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ANKRD28-215ENST00000624145 ANTXR2P58335 489 aa3.99□□□□□ -1.77
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ANKRD28-215ENST00000624145 WSCD1Q658N2 575 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 USP49Q70CQ1 688 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 CUZD1Q86UP6 607 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 SLC30A8Q8IWU4 369 aa3.99□□□□□ -1.77
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ANKRD28-215ENST00000624145 ASB12Q8WXK4 309 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 SLC25A36Q96CQ1 311 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 CDT1Q9H211 546 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 DPEP2Q9H4A9 486 aa3.99□□□□□ -1.77
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ANKRD28-215ENST00000624145 C1orf109Q9NX04 203 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 CFAP97Q9P2B7 532 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 DEC1Q9P2X7 70 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 NPIPA1Q9UND3 350 aa3.99□□□□□ -1.77
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ANKRD28-215ENST00000624145 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 DUSP10Q9Y6W6 482 aa3.99□□□□□ -1.77
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ANKRD28-215ENST00000624145 HSBP1L1C9JCN9 74 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 KCNJ13O60928 360 aa3.99□□□□□ -1.77
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ANKRD28-215ENST00000624145 PET100P0DJ07 73 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 EPHA3P29320 983 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 SPAM1P38567 509 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 CASP6P55212 293 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 CDH12P55289 794 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 PER3P56645 1201 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 PPATQ06203 517 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 SEMA5AQ13591 1074 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 EML3Q32P44 896 aa3.99□□□□□ -1.77
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