RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620394.1

SRRT-218, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-218ENST00000620394 F8A1P23610 371 aa21.54■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 UQCRFS1P47985 274 aa21.54■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 SEPHS1P49903 392 aa21.54■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 VAV2P52735 878 aa21.54■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 PMS2P54278 862 aa21.54■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 XIAPP98170 497 aa21.54■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 FOXM1Q08050 763 aa21.54■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 OLIG2Q13516 323 aa21.54■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 BCL7AQ4VC05 210 aa21.54■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 CACHD1Q5VU97 1274 aa21.54■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 EFCAB3Q8N7B9 438 aa21.54■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 GALNT11Q8NCW6 608 aa21.54■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 OR4K2Q8NGD2 314 aa21.54■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 ARNT2Q9HBZ2 717 aa21.54■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 FKBPLQ9UIM3 349 aa21.54■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 CROTQ9UKG9 612 aa21.54■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 MGAT4DA6NG13 374 aa21.53■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 SGTAO43765 313 aa21.53■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 RASSF9O75901 435 aa21.53■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 TJP3O95049 919 aa21.53■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 FGF5P12034 268 aa21.53■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 ZNF28P17035 718 aa21.53■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 NELFEP18615 380 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 MSH3P20585 1137 aa21.53■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 AKT1P31749 480 aa21.53■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 PPP1CAP62136 330 aa21.53■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 PDE1BQ01064 536 aa21.53■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 ERV3-1Q14264 604 aa21.53■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 PRPSAP1Q14558 356 aa21.53■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 FNBP1LQ5T0N5 605 aa21.53■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 DENND5AQ6IQ26 1287 aa21.53■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 IRGCQ6NXR0 463 aa21.53■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 KLHL35Q6PF15 583 aa21.53■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 OR2L2Q8NH16 312 aa21.53■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 CCDC110Q8TBZ0 833 aa21.53■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 UBXN4Q92575 508 aa21.53■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa21.53■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 SLC41A2Q96JW4 573 aa21.53■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 OR6C1Q96RD1 312 aa21.53■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 APOL2Q9BQE5 337 aa21.53■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 KCND3Q9UK17 655 aa21.53■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 PSMD13Q9UNM6 376 aa21.53■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 PYGMP11217 842 aa21.52■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP21.52■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa21.52■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 AADACL2Q6P093 401 aa21.52■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 CYB5D1Q6P9G0 228 aa21.52■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 FAM92BQ6ZTR7 304 aa21.52■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 ACRBPQ8NEB7 543 aa21.52■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 SSC4DQ8WTU2 575 aa21.52■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 FAM118BQ9BPY3 351 aa21.52■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 ASB8Q9H765 288 aa21.52■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 ACSL5Q9ULC5 683 aa21.52■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa21.52■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 CRTAMO95727 393 aa21.51■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 CETN2P41208 172 aa21.51■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 PRLHRP49683 370 aa21.51■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 GALNT6Q8NCL4 622 aa21.51■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 OR13C4Q8NGS5 318 aa21.51■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 ZFPM2Q8WW38 1151 aa21.51■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 ULK4Q96C45 1275 aa21.51■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 CD180Q99467 661 aa21.51■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 TBL1YQ9BQ87 522 aa21.51■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 RBSNQ9H1K0 784 aa21.51■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 TLK1Q9UKI8 766 aa21.51■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa21.5■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 CDC14CA4D256 554 aa21.5■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 OR5K3A6NET4 321 aa21.5■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 ENO4A6NNW6 628 aa21.5■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 RECKO95980 971 aa21.5■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 FURINP09958 794 aa21.5■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 GNLYP22749 145 aa21.5■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 KCTD11Q693B1 232 aa21.5■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 DET1Q7L5Y6 550 aa21.5■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 KMT5CQ86Y97 462 aa21.5■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 TMEM139Q8IV31 216 aa21.5■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 NXPE1Q8N323 547 aa21.5■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 CPT1CQ8TCG5 803 aa21.5■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 RMDN2Q96LZ7 410 aa21.5■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 WWP1Q9H0M0 922 aa21.5■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa21.5■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa21.49■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 TLCD2A6NGC4 264 aa21.49■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 TTLL8A6PVC2 850 aa21.49■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 LDB2O43679 373 aa21.49■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 KIAA0754O94854 1291 aa21.49■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 ITGALP20701 1170 aa21.49■■□□□ 1.03
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