RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616920.1

CYCSP41-201, Transcript of cytochrome c, somatic pseudogene 41, humanhuman

BASIC

Gene CYCSP41, Length 296 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYCSP41-201ENST00000616920 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 PZPP20742 1482 aa4.56□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 PTPN23Q9H3S7 1636 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 TMEM8BA6NDV4 472 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 C5orf60A6NFR6 353 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 FAM72CH0Y354 149 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 PLK4O00444 970 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 BAG4O95429 457 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 TFAP2AP05549 437 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 LIPFP07098 398 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 PON1P27169 355 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 GARSP41250 739 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 MBTD1Q05BQ5 628 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 SPOCK1Q08629 439 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 ASPRV1Q53RT3 343 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 FAM72AQ5TYM5 149 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 FAM72DQ6L9T8 149 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 TPRG1Q6ZUI0 275 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 FAM72BQ86X60 149 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 SCYL3Q8IZE3 742 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 ADGRF2Q8IZF7 708 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 FBXO17Q96EF6 278 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 TIGD1Q96MW7 591 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 HGH1Q9BTY7 390 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 MAF1Q9H063 256 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 PTTG2Q9NZH5 202 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 PNMA2Q9UL42 364 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 STRCQ7RTU9 1775 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 FGD6Q6ZV73 1430 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 CROCC2H7BZ55 1655 aa4.54□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 A0A0G2JNG1 304 aa4.54□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 C15orf62A8K5M9 175 aa4.54□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 VILLO15195 856 aa4.54□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 DOK2O60496 412 aa4.54□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 PDE9AO76083 593 aa4.54□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 TIMP3P35625 211 aa4.54□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 RXRGP48443 463 aa4.54□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 KIR2DS5Q14953 304 aa4.54□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 PACS1Q6VY07 963 aa4.54□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa4.54□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 GALNT13Q8IUC8 556 aa4.54□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 SCRN2Q96FV2 425 aa4.54□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa4.54□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 SYNCQ9H7C4 482 aa4.54□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 TCF19Q9Y242 345 aa4.54□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 YIPF1Q9Y548 306 aa4.54□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa4.54□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 A2ML1A8K2U0 1454 aa4.54□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 PTPRKQ15262 1439 aa4.54□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 NCOA1Q15788 1441 aa4.54□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 DEPDC5O75140 1603 aa4.54□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 CAVIN2O95810 425 aa4.53□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 GH2P01242 217 aa4.53□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 KCNC3Q14003 757 aa4.53□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 IRF3Q14653 427 aa4.53□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 RAB6CQ53S08 254 aa4.53□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa4.53□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa4.53□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 ZNF449Q6P9G9 518 aa4.53□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 SLC27A1Q6PCB7 646 aa4.53□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 ZNF534Q76KX8 674 aa4.53□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa4.53□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 KLHDC9Q8NEP7 349 aa4.53□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 SEMA4DQ92854 862 aa4.53□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 SLX1AQ9BQ83 275 aa4.53□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 RAB6CQ9H0N0 254 aa4.53□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa4.53□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 SLC38A7Q9NVC3 462 aa4.53□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 DAPK1P53355 1430 aa4.53□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa4.53□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 MYO3AQ8NEV4 1616 aa4.53□□□□□ -1.68
CYCSP41-201ENST00000616920 ROCK1Q13464 1354 aa4.53□□□□□ -1.69
CYCSP41-201ENST00000616920 TNRQ92752 1358 aa4.53□□□□□ -1.69
CYCSP41-201ENST00000616920 KIF15Q9NS87 1388 aa4.53□□□□□ -1.69
CYCSP41-201ENST00000616920 ADGRL2O95490 1459 aa4.52□□□□□ -1.69
CYCSP41-201ENST00000616920 A0A1W2PPI3 338 aa4.52□□□□□ -1.69
CYCSP41-201ENST00000616920 FSD2A1L4K1 749 aa4.52□□□□□ -1.69
CYCSP41-201ENST00000616920 OR2M5A3KFT3 312 aa4.52□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms