RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584229.1

GPS1-223, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 535 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-223	ENST00000584229	VIP	P01282	170 aa		24.43	■■□□□ 1.5
GPS1-223	ENST00000584229	ESR1	P03372	595 aa		24.43	■■□□□ 1.5
GPS1-223	ENST00000584229	MGAT5	Q09328	741 aa		24.43	■■□□□ 1.5
GPS1-223	ENST00000584229	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		24.43	■■□□□ 1.5
GPS1-223	ENST00000584229	DHRS13	Q6UX07	377 aa		24.43	■■□□□ 1.5
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF761	Q86XN6	746 aa	Predicted RBP	24.43	■■□□□ 1.5
GPS1-223	ENST00000584229	C2CD4A	Q8NCU7	369 aa	Predicted RBP	24.43	■■□□□ 1.5
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM159	Q96B96	161 aa		24.43	■■□□□ 1.5
GPS1-223	ENST00000584229	C12orf66	Q96MD2	445 aa		24.43	■■□□□ 1.5
GPS1-223	ENST00000584229	PTPRB	P23467	1997 aa		24.43	■■□□□ 1.5
GPS1-223	ENST00000584229	ASXL3	Q9C0F0	2248 aa		24.42	■■□□□ 1.5
GPS1-223	ENST00000584229	PRR19	A6NJB7	356 aa		24.42	■■□□□ 1.5
GPS1-223	ENST00000584229		H3BMM5	538 aa		24.42	■■□□□ 1.5
GPS1-223	ENST00000584229	LIN7A	O14910	233 aa	Predicted RBP	24.42	■■□□□ 1.5
GPS1-223	ENST00000584229	NUDT21	O43809	227 aa	Known RBP	24.42	■■□□□ 1.5
GPS1-223	ENST00000584229	HAUS5	O94927	633 aa		24.42	■■□□□ 1.5
GPS1-223	ENST00000584229	PKM	P14618	531 aa	Known RBP	24.42	■■□□□ 1.5
GPS1-223	ENST00000584229	BRAF	P15056	766 aa		24.42	■■□□□ 1.5
GPS1-223	ENST00000584229	CHRM3	P20309	590 aa		24.42	■■□□□ 1.5
GPS1-223	ENST00000584229	ABCG1	P45844	678 aa		24.42	■■□□□ 1.5
GPS1-223	ENST00000584229	KRT33B	Q14525	404 aa		24.42	■■□□□ 1.5
GPS1-223	ENST00000584229	CLCA4	Q14CN2	919 aa		24.42	■■□□□ 1.5
GPS1-223	ENST00000584229	C3orf62	Q6ZUJ4	267 aa		24.42	■■□□□ 1.5
GPS1-223	ENST00000584229	SLC38A3	Q99624	504 aa		24.42	■■□□□ 1.5
GPS1-223	ENST00000584229	TSPYL1	Q9H0U9	437 aa		24.42	■■□□□ 1.5
GPS1-223	ENST00000584229	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		24.42	■■□□□ 1.5
GPS1-223	ENST00000584229	TSR3	Q9UJK0	312 aa	Known RBP	24.42	■■□□□ 1.5
GPS1-223	ENST00000584229	PCDHGA1	Q9Y5H4	931 aa		24.42	■■□□□ 1.5
GPS1-223	ENST00000584229	IFRD1	O00458	451 aa	Predicted RBP	24.41	■■□□□ 1.5
GPS1-223	ENST00000584229	APOA4	P06727	396 aa		24.41	■■□□□ 1.5
GPS1-223	ENST00000584229	GP1BA	P07359	652 aa		24.41	■■□□□ 1.5
GPS1-223	ENST00000584229	ALDH4A1	P30038	563 aa		24.41	■■□□□ 1.5
GPS1-223	ENST00000584229	MAPK9	P45984	424 aa		24.41	■■□□□ 1.5
GPS1-223	ENST00000584229	HSPA14	Q0VDF9	509 aa		24.41	■■□□□ 1.5
GPS1-223	ENST00000584229	FOXC1	Q12948	553 aa		24.41	■■□□□ 1.5
GPS1-223	ENST00000584229	CBLB	Q13191	982 aa		24.41	■■□□□ 1.5
GPS1-223	ENST00000584229	ILK	Q13418	452 aa		24.41	■■□□□ 1.5
GPS1-223	ENST00000584229	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		24.41	■■□□□ 1.5
GPS1-223	ENST00000584229	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	24.41	■■□□□ 1.5
GPS1-223	ENST00000584229	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	24.41	■■□□□ 1.5
GPS1-223	ENST00000584229	CNST	Q6PJW8	725 aa		24.41	■■□□□ 1.5
GPS1-223	ENST00000584229	ABRAXAS1	Q6UWZ7	409 aa		24.41	■■□□□ 1.5
GPS1-223	ENST00000584229	WASH2P	Q6VEQ5	465 aa		24.41	■■□□□ 1.5
GPS1-223	ENST00000584229	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		24.41	■■□□□ 1.5
GPS1-223	ENST00000584229	AVL9	Q8NBF6	648 aa		24.41	■■□□□ 1.5
GPS1-223	ENST00000584229	SPDYE1	Q8NFV5	336 aa	Predicted RBP	24.41	■■□□□ 1.5
GPS1-223	ENST00000584229	CDKL2	Q92772	493 aa		24.41	■■□□□ 1.5
GPS1-223	ENST00000584229	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		24.41	■■□□□ 1.5
GPS1-223	ENST00000584229	RMDN2	Q96LZ7	410 aa		24.41	■■□□□ 1.5
GPS1-223	ENST00000584229	BIRC8	Q96P09	236 aa		24.41	■■□□□ 1.5
GPS1-223	ENST00000584229	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		24.41	■■□□□ 1.5
GPS1-223	ENST00000584229	RABGEF1	Q9UJ41	708 aa		24.41	■■□□□ 1.5
GPS1-223	ENST00000584229	PPM1D	O15297	605 aa		24.4	■■□□□ 1.5
GPS1-223	ENST00000584229	GSTA2	P09210	222 aa		24.4	■■□□□ 1.5
GPS1-223	ENST00000584229	PDHA2	P29803	388 aa		24.4	■■□□□ 1.5
GPS1-223	ENST00000584229	ECHS1	P30084	290 aa		24.4	■■□□□ 1.5
GPS1-223	ENST00000584229	CCR7	P32248	378 aa		24.4	■■□□□ 1.5
GPS1-223	ENST00000584229	LEPR	P48357	1165 aa	Known RBP	24.4	■■□□□ 1.5
GPS1-223	ENST00000584229	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	24.4	■■□□□ 1.5
GPS1-223	ENST00000584229	RPE65	Q16518	533 aa		24.4	■■□□□ 1.5
GPS1-223	ENST00000584229	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		24.4	■■□□□ 1.5
GPS1-223	ENST00000584229	OTOA	Q7RTW8	1153 aa		24.4	■■□□□ 1.5
GPS1-223	ENST00000584229	C17orf82	Q86X59	251 aa	Predicted RBP	24.4	■■□□□ 1.5
GPS1-223	ENST00000584229	SKA2	Q8WVK7	121 aa	Predicted RBP	24.4	■■□□□ 1.5
GPS1-223	ENST00000584229	NDN	Q99608	321 aa		24.4	■■□□□ 1.5
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF624	Q9P2J8	865 aa	Predicted RBP	24.4	■■□□□ 1.5
GPS1-223	ENST00000584229	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		24.4	■■□□□ 1.5
GPS1-223	ENST00000584229	ZW10	O43264	779 aa		24.39	■■□□□ 1.49
GPS1-223	ENST00000584229	PIAS1	O75925	651 aa		24.39	■■□□□ 1.49
GPS1-223	ENST00000584229	RPLP0	P05388	317 aa	Known RBP	24.39	■■□□□ 1.49
GPS1-223	ENST00000584229	STX2	P32856	288 aa		24.39	■■□□□ 1.49
GPS1-223	ENST00000584229	SLC19A1	P41440	591 aa		24.39	■■□□□ 1.49
GPS1-223	ENST00000584229	FASLG	P48023	281 aa		24.39	■■□□□ 1.49
GPS1-223	ENST00000584229	CD151	P48509	253 aa		24.39	■■□□□ 1.49
GPS1-223	ENST00000584229	ADAR	P55265	1226 aa	Known RBP	24.39	■■□□□ 1.49
GPS1-223	ENST00000584229	CLDN6	P56747	220 aa		24.39	■■□□□ 1.49
GPS1-223	ENST00000584229	GPX6	P59796	221 aa		24.39	■■□□□ 1.49
GPS1-223	ENST00000584229	E2F1	Q01094	437 aa		24.39	■■□□□ 1.49
GPS1-223	ENST00000584229	RPA4	Q13156	261 aa		24.39	■■□□□ 1.49
GPS1-223	ENST00000584229	AMZ1	Q400G9	498 aa		24.39	■■□□□ 1.49
GPS1-223	ENST00000584229	XKR5	Q6UX68	686 aa		24.39	■■□□□ 1.49
GPS1-223	ENST00000584229	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		24.39	■■□□□ 1.49
GPS1-223	ENST00000584229	CTAGE3P	Q8IX95	158 aa		24.39	■■□□□ 1.49
GPS1-223	ENST00000584229	GSPT2	Q8IYD1	628 aa	Known RBP	24.39	■■□□□ 1.49
GPS1-223	ENST00000584229	SH3KBP1	Q96B97	665 aa		24.39	■■□□□ 1.49
GPS1-223	ENST00000584229	INSM2	Q96T92	566 aa	Predicted RBP	24.39	■■□□□ 1.49
GPS1-223	ENST00000584229	LRRC4C	Q9HCJ2	640 aa		24.39	■■□□□ 1.49
GPS1-223	ENST00000584229	POT1	Q9NUX5	634 aa		24.39	■■□□□ 1.49
GPS1-223	ENST00000584229	KCNK4	Q9NYG8	393 aa		24.39	■■□□□ 1.49
GPS1-223	ENST00000584229	TCRBV9S1A1T	A0A576	114 aa		24.38	■■□□□ 1.49
GPS1-223	ENST00000584229	KPNA5	O15131	536 aa		24.38	■■□□□ 1.49
GPS1-223	ENST00000584229	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	24.38	■■□□□ 1.49
GPS1-223	ENST00000584229	XRCC1	P18887	633 aa	Predicted RBP	24.38	■■□□□ 1.49
GPS1-223	ENST00000584229	PHB	P35232	272 aa		24.38	■■□□□ 1.49
GPS1-223	ENST00000584229	OR1D5	P58170	312 aa		24.38	■■□□□ 1.49
GPS1-223	ENST00000584229	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	24.38	■■□□□ 1.49
GPS1-223	ENST00000584229	KYNU	Q16719	465 aa		24.38	■■□□□ 1.49
GPS1-223	ENST00000584229	SPRED1	Q7Z699	444 aa		24.38	■■□□□ 1.49
GPS1-223	ENST00000584229	GPATCH11	Q8N954	259 aa		24.38	■■□□□ 1.49
GPS1-223	ENST00000584229	ASZ1	Q8WWH4	475 aa		24.38	■■□□□ 1.49

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