RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578093.1

PTPRM-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 3

Gene PTPRM, Length 464 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-206	ENST00000578093	PDP2	Q9P2J9	529 aa		3.91	□□□□□ -1.78
PTPRM-206	ENST00000578093	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		3.91	□□□□□ -1.78
PTPRM-206	ENST00000578093	CD84	Q9UIB8	345 aa		3.91	□□□□□ -1.78
PTPRM-206	ENST00000578093	KCND3	Q9UK17	655 aa		3.91	□□□□□ -1.78
PTPRM-206	ENST00000578093	NOCT	Q9UK39	431 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
PTPRM-206	ENST00000578093	CROT	Q9UKG9	612 aa		3.91	□□□□□ -1.78
PTPRM-206	ENST00000578093	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		3.91	□□□□□ -1.78
PTPRM-206	ENST00000578093	SLC17A4	Q9Y2C5	497 aa		3.91	□□□□□ -1.78
PTPRM-206	ENST00000578093	TMEM98	Q9Y2Y6	226 aa		3.91	□□□□□ -1.78
PTPRM-206	ENST00000578093	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		3.91	□□□□□ -1.78
PTPRM-206	ENST00000578093	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		3.91	□□□□□ -1.78
PTPRM-206	ENST00000578093	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		3.91	□□□□□ -1.78
PTPRM-206	ENST00000578093	VPS13C	Q709C8	3753 aa		3.91	□□□□□ -1.78
PTPRM-206	ENST00000578093	MN1	Q10571	1320 aa	Predicted RBP	3.91	□□□□□ -1.78
PTPRM-206	ENST00000578093	SPTB	P11277	2137 aa		3.91	□□□□□ -1.78
PTPRM-206	ENST00000578093	CCDC88C	Q9P219	2028 aa		3.9	□□□□□ -1.78
PTPRM-206	ENST00000578093	F8	P00451	2351 aa		3.9	□□□□□ -1.78
PTPRM-206	ENST00000578093	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	CFAP69	A5D8W1	941 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093		A6NCN8	305 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	GOLGA6C	A6NDK9	693 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	GOLGA6B	A6NDN3	693 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093		H7BY64	318 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	EPHB6	O15197	1021 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	INPP4B	O15327	924 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	RFPL1	O75677	317 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	KRT38	O76015	456 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	GFPT2	O94808	682 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	ASMTL	O95671	621 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	LSM8	O95777	96 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	PEX11B	O96011	259 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	IVL	P07476	585 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	GOLGA6D	P0CG33	693 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	CTPS1	P17812	591 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	GPD1	P21695	349 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	MMP8	P22894	467 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	HSD3B2	P26439	372 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	VIPR1	P32241	457 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	TRHR	P34981	398 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	DLST	P36957	453 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	BUD31	P41223	144 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	PPP1R2	P41236	205 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	MAPK9	P45984	424 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	GPR3	P46089	330 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	FASLG	P48023	281 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	PMS2	P54278	862 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	YBEY	P58557	167 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	MAX	P61244	160 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	RPL7A	P62424	266 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	BCL2L1	Q07817	233 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	SLC10A7	Q0GE19	358 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	IL10RA	Q13651	578 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	ERV3-1	Q14264	604 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	IHH	Q14623	411 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	MAN2A1	Q16706	1144 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	CLPP	Q16740	277 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	EIF2S3L	Q2VIR3	472 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	FHL5	Q5TD97	284 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	BICRAL	Q6AI39	1079 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	TCTN3	Q6NUS6	607 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	SCYL2	Q6P3W7	929 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	WDR59	Q6PJI9	974 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	CEACAM20	Q6UY09	585 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093		Q6ZVL8	140 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	ASB18	Q6ZVZ8	466 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	CYP4V2	Q6ZWL3	525 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	KDELC2	Q7Z4H8	507 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	SLFN11	Q7Z7L1	901 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	UMODL1-AS1	Q8N2C9	162 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	PGBD5	Q8N414	524 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	SFRP1	Q8N474	314 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	POU5F2	Q8N7G0	328 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	TEX19	Q8NA77	164 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	CPT1C	Q8TCG5	803 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	HCAR2	Q8TDS4	363 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	CT55	Q8WUE5	264 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	PDCD6IP	Q8WUM4	868 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	FAM168A	Q92567	244 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	SCAMP4	Q969E2	229 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	KIAA1143	Q96AT1	154 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	FAM81B	Q96LP2	452 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	ZNF641	Q96N77	438 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	MCEE	Q96PE7	176 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	TEFM	Q96QE5	360 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	OR2M4	Q96R27	311 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	CINP	Q9BW66	212 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	RNF32	Q9H0A6	362 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	ABCG8	Q9H221	673 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PTPRM-206	ENST00000578093	ATP13A3	Q9H7F0	1226 aa		3.9	□□□□□ -1.79

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