RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 ENOPH1Q9UHY7 261 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 TSPAN16Q9UKR8 245 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 SNX7Q9UNH6 387 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 MTMR6Q9Y217 621 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 RNF24Q9Y225 148 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 GINS2Q9Y248 185 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 HEY1Q9Y5J3 304 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 PSAT1Q9Y617 370 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 KIF27Q86VH2 1401 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 COL15A1P39059 1388 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 SALL3Q9BXA9 1300 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 A0A1W2PQ09 198 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 RAB19A4D1S5 217 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 HMX3A6NHT5 357 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 B4E1Z4 1266 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 UBE2Q2LH0YL09 131 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 LAD1O00515 517 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 PPM1DO15297 605 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 B4GAT1O43505 415 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 LPXNO60711 386 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 DTNBO60941 627 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 DDNO94850 711 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 UFL1O94874 794 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 PDE8BO95263 885 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 AHSA1O95433 338 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 KRT75O95678 551 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 DHFRP00374 187 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 SERPINA3P01011 423 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 LDLRP01130 860 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 CALCAP01258 141 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 PCCBP05166 539 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 CALB1P05937 261 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 FABP1P07148 127 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 TUBBP07437 444 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 CNPP09543 421 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 THRBP10828 461 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 HK1P19367 917 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 PTNP21246 168 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 FGFR2P21802 821 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 SP100P23497 879 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 CPT2P23786 658 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 PTPN3P26045 913 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 TNFRSF8P28908 595 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 PTPN6P29350 595 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 PPP2R1AP30153 589 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 CDC25AP30304 524 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 TM4SF1P30408 202 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 BMPR1AP36894 532 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 MCAMP43121 646 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 KIR2DL3P43628 341 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 GPR4P46093 362 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 ENTPD1P49961 510 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 NPY4RP50391 375 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 IST1P53990 364 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 ADKP55263 362 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 PRMT2P55345 433 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 BCAR1P56945 870 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 SPCS3P61009 180 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 MXRA7P84157 204 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 NHLH1Q02575 133 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 ROM1Q03395 351 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 C2orf54Q08AI8 447 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 GALNT2Q10471 571 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 FOXF2Q12947 444 aa3.02□□□□□ -1.93
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PTPRM-204ENST00000577468 IL18Q14116 193 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 DAG1Q14118 895 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 GAMTQ14353 236 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 GPR176Q14439 515 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 FAM187BQ17R55 369 aa3.02□□□□□ -1.93
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PTPRM-204ENST00000577468 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 TBRG1Q3YBR2 411 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 BCL7AQ4VC05 210 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 KLHL26Q53HC5 615 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 YIF1BQ5BJH7 314 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 XKR4Q5GH76 650 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 PLAC9Q5JTB6 97 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 C9orf152Q5JTZ5 239 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF484Q5JVG2 852 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 BRMS1LQ5PSV4 323 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 CATSPEREQ5SY80 951 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 MARCH8Q5T0T0 291 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 ARMC12Q5T9G4 340 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 LCN1P1Q5VSP4 162 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 FAM171A1Q5VUB5 890 aa3.02□□□□□ -1.93
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