RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	RALGPS2	Q86X27	583 aa	Predicted RBP	18.12	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	CROCCP3	Q8IVE0	287 aa		18.12	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	DTWD1	Q8N5C7	304 aa		18.12	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	GLB1L3	Q8NCI6	653 aa	Predicted RBP	18.12	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		18.12	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	UGT2B28	Q9BY64	529 aa		18.12	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	CXorf21	Q9HAI6	301 aa		18.12	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	STOML2	Q9UJZ1	356 aa		18.12	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	OARD1	Q9Y530	152 aa		18.12	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	POLR3H	Q9Y535	204 aa	Predicted RBP	18.12	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	SNAP29	O95721	258 aa		18.11	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	LATS1	O95835	1130 aa		18.11	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	HMGA1	P17096	107 aa	Known RBP	18.11	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	GGT1	P19440	569 aa		18.11	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	AKT1	P31749	480 aa		18.11	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	OR1D2	P34982	312 aa		18.11	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	ALDH3A2	P51648	485 aa		18.11	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	ABRAXAS2	Q15018	415 aa		18.11	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	LYPLAL1	Q5VWZ2	237 aa		18.11	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	RDH12	Q96NR8	316 aa		18.11	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	SH3GL1	Q99961	368 aa		18.11	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	TUBA1C	Q9BQE3	449 aa		18.11	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	KLF16	Q9BXK1	252 aa	Predicted RBP	18.11	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	PIF1	Q9H611	641 aa		18.11	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	GORASP2	Q9H8Y8	452 aa		18.11	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		18.11	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	CDH7	Q9ULB5	785 aa		18.11	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	ANGPTL3	Q9Y5C1	460 aa		18.11	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		18.11	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	SLC28A1	O00337	649 aa		18.11	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	18.11	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	IRF1	P10914	325 aa		18.11	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	SOX11	P35716	441 aa		18.11	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	ARSF	P54793	590 aa		18.11	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	MTPN	P58546	118 aa		18.11	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	TAF12	Q16514	161 aa		18.11	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	RFTN2	Q52LD8	501 aa	Predicted RBP	18.11	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	LYSMD3	Q7Z3D4	306 aa		18.11	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	SERPINA9	Q86WD7	417 aa		18.11	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	OFCC1	Q8IZS5	231 aa		18.11	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	SLC13A3	Q8WWT9	602 aa		18.11	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	MYO19	Q96H55	970 aa		18.11	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	CNDP2	Q96KP4	475 aa	Known RBP	18.11	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	18.11	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	FEM1A	Q9BSK4	669 aa		18.11	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	18.11	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	USP22	Q9UPT9	525 aa		18.11	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559		A0A1W2PQ45	241 aa	Predicted RBP	18.1	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559		A0A1W2PQY0	241 aa		18.1	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	ADAM12	O43184	909 aa		18.1	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	NBN	O60934	754 aa		18.1	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	KATNA1	O75449	491 aa		18.1	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	WDR47	O94967	919 aa		18.1	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	PGLS	O95336	258 aa		18.1	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	PRAMEF1	O95521	474 aa		18.1	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	CLIC3	O95833	236 aa		18.1	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	HPR	P00739	348 aa		18.1	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	SLC2A4	P14672	509 aa		18.1	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	ITGAL	P20701	1170 aa		18.1	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	PPP3CC	P48454	512 aa		18.1	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	HLCS	P50747	726 aa		18.1	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	SNX20	Q7Z614	316 aa		18.1	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	18.1	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	POP5	Q969H6	163 aa	Known RBP	18.1	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	C12orf43	Q96C57	262 aa	Known RBP	18.1	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	SDCCAG3	Q96C92	435 aa		18.1	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		18.1	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	NSUN3	Q9H649	340 aa	Known RBP	18.1	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	LIN28A	Q9H9Z2	209 aa	Known RBP	18.1	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	HCST	Q9UBK5	93 aa		18.1	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	PCDHGA11	Q9Y5H2	935 aa		18.1	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559		V9GYQ6	96 aa		18.1	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	IL6	P05231	212 aa		18.1	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	DCK	P27707	260 aa		18.1	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	BFSP2	Q13515	415 aa		18.1	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	DAG1	Q14118	895 aa		18.1	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	PTPRR	Q15256	657 aa		18.1	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		18.1	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	SULT1C3	Q6IMI6	304 aa		18.1	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	HJURP	Q8NCD3	748 aa	Predicted RBP	18.1	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	OR2T12	Q8NG77	320 aa		18.1	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	DOK1	Q99704	481 aa		18.1	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	OSBPL6	Q9BZF3	934 aa		18.1	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	NTN4	Q9HB63	628 aa		18.1	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	SMPD4	Q9NXE4	827 aa		18.1	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	OPTC	Q9UBM4	332 aa		18.1	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	CCL27	Q9Y4X3	112 aa		18.1	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		18.09	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	GSTA4	O15217	222 aa		18.09	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	TBL1X	O60907	577 aa		18.09	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	MT-ND1	P03886	318 aa		18.09	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	18.09	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	NFKBIA	P25963	317 aa		18.09	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	HSPA7	P48741	367 aa		18.09	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	DGKQ	P52824	942 aa		18.09	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	EPS8	Q12929	822 aa		18.09	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	KIAA0040	Q15053	153 aa		18.09	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	C18orf21	Q32NC0	220 aa	Predicted RBP	18.09	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	OTUD3	Q5T2D3	398 aa	Predicted RBP	18.09	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	FAM151B	Q6UXP7	276 aa		18.09	■□□□□ 0.49

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