RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534197.5

GNPTG-209, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunit gamma, humanhuman

TSL 3

Gene GNPTG, Length 420 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTG-209ENST00000534197 SLC38A9Q8NBW4 561 aa21.49■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 OR2L2Q8NH16 312 aa21.49■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 RMDN2Q96LZ7 410 aa21.49■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 FAM118BQ9BPY3 351 aa21.49■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 ASB8Q9H765 288 aa21.49■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 SLC24A2Q9UI40 661 aa21.49■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa21.49■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 CCDC88CQ9P219 2028 aa21.48■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 CLEC18AA5D8T8 446 aa21.48■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 TLCD2A6NGC4 264 aa21.48■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 MT-ND3P03897 115 aa21.48■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 PSMB4P28070 264 aa21.48■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 PMS2P54278 862 aa21.48■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 GEMP55040 296 aa21.48■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 KLRB1Q12918 225 aa21.48■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa21.48■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 C11orf63Q6NUN7 778 aa21.48■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 KLHL35Q6PF15 583 aa21.48■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 CLEC18BQ6UXF7 455 aa21.48■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 CLEC18CQ8NCF0 446 aa21.48■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 OR13C4Q8NGS5 318 aa21.48■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 ACTL9Q8TC94 416 aa21.48■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 FCRL4Q96PJ5 515 aa21.48■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 ANP32EQ9BTT0 268 aa21.48■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 FAM96AQ9H5X1 160 aa21.48■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 FER1L5A0AVI2 2057 aa21.48■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 OR6C74A6NCV1 312 aa21.47■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 RCCD1A6NED2 376 aa21.47■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 AGAP14A8MT82 685 aa21.47■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 C21orf140B9A014 251 aa21.47■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 MKRN2OSH3BPM6 223 aa21.47■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 CCL22O00626 93 aa21.47■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 POLBP06746 335 aa21.47■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 HSD11B2P80365 405 aa21.47■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 ACY1Q03154 408 aa21.47■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 IL10RAQ13651 578 aa21.47■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 BCL7AQ4VC05 210 aa21.47■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa21.47■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa21.47■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa21.47■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 KMT5CQ86Y97 462 aa21.47■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 MIB2Q96AX9 1013 aa21.47■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 CD180Q99467 661 aa21.47■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa21.47■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 ANKMY1Q9P2S6 941 aa21.47■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 RFPL1O75677 317 aa21.46■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 ANXA9O76027 345 aa21.46■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 RECKO95980 971 aa21.46■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 MLLT10P55197 1068 aa21.46■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 TUBB4BP68371 445 aa21.46■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 TMPRSS15P98073 1019 aa21.46■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 GPS2Q13227 327 aa21.46■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 SEMA5AQ13591 1074 aa21.46■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 TUBB2AQ13885 445 aa21.46■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 CPZQ66K79 652 aa21.46■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 DENND5AQ6IQ26 1287 aa21.46■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 LCN10Q6JVE6 187 aa21.46■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 AADACL2Q6P093 401 aa21.46■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 CYB5D1Q6P9G0 228 aa21.46■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 ASB18Q6ZVZ8 466 aa21.46■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 OOSP2Q86WS3 158 aa21.46■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 CFAP206Q8IYR0 622 aa21.46■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 TUBB2BQ9BVA1 445 aa21.46■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 ACSL5Q9ULC5 683 aa21.46■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa21.46■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 C5orf60A6NFR6 353 aa21.45■■□□□ 1.02
GNPTG-209ENST00000534197 C2orf81A6NN90 581 aa21.45■■□□□ 1.02
GNPTG-209ENST00000534197 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
GNPTG-209ENST00000534197 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
GNPTG-209ENST00000534197 PTMSP20962 102 aa21.45■■□□□ 1.02
GNPTG-209ENST00000534197 PTPN4P29074 926 aa21.45■■□□□ 1.02
GNPTG-209ENST00000534197 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
GNPTG-209ENST00000534197 ARL4DP49703 201 aa21.45■■□□□ 1.02
GNPTG-209ENST00000534197 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
GNPTG-209ENST00000534197 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
GNPTG-209ENST00000534197 SPARCL1Q14515 664 aa21.45■■□□□ 1.02
GNPTG-209ENST00000534197 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
GNPTG-209ENST00000534197 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
GNPTG-209ENST00000534197 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
GNPTG-209ENST00000534197 OR4E2Q8NGC2 313 aa21.45■■□□□ 1.02
GNPTG-209ENST00000534197 CCDC110Q8TBZ0 833 aa21.45■■□□□ 1.02
GNPTG-209ENST00000534197 ZFPM2Q8WW38 1151 aa21.45■■□□□ 1.02
GNPTG-209ENST00000534197 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP21.45■■□□□ 1.02
GNPTG-209ENST00000534197 DUSP10Q9Y6W6 482 aa21.45■■□□□ 1.02
GNPTG-209ENST00000534197 SHANK1Q9Y566 2161 aa21.44■■□□□ 1.02
GNPTG-209ENST00000534197 PCSK5Q92824 1860 aa21.44■■□□□ 1.02
GNPTG-209ENST00000534197 SCRG1O75711 98 aa21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms