RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516577.1

RNU6-1018P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1018, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1018P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 DPPA4Q7L190 304 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TSPAN33Q86UF1 283 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF547Q8IVP9 402 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PAF1Q8N7H5 531 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NUP37Q8NFH4 326 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 OR6Y1Q8NGX8 325 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 HSD17B8Q92506 261 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 DYRK2Q92630 601 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 IGSF8Q969P0 613 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TTC17Q96AE7 1141 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF799Q96GE5 643 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF597Q96LX8 424 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CEP295NLQ96MC4 621 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NECTIN4Q96NY8 510 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ACOX2Q99424 681 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 EYA3Q99504 573 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 EBF4Q9BQW3 602 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TUBB1Q9H4B7 451 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ARFGAP3Q9NP61 516 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PLSCR3Q9NRY6 295 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 HSPB7Q9UBY9 170 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SLC7A7Q9UM01 511 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TENM1Q9UKZ4 2725 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GOLGA6CA6NDK9 693 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GOLGA6BA6NDN3 693 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PEX12O00623 359 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ANP32CO43423 234 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 URODP06132 367 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GOLGA6DP0CG33 693 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TNNT1P13805 278 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 POU1F1P28069 291 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CAPGP40121 348 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TECP42680 631 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 LMAN1P49257 510 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 KHKP50053 298 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 OLIG2Q13516 323 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TIGD6Q17RP2 521 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ATAD3CQ5T2N8 411 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GPR157Q5UAW9 335 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RNLSQ5VYX0 342 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 KIF6Q6ZMV9 814 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CATSPERDQ86XM0 798 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PRR22Q8IZ63 422 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RILPL2Q969X0 211 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TMEM41AQ96HV5 264 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CCDC138Q96M89 665 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PCGF1Q9BSM1 259 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 HES7Q9BYE0 225 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ASB8Q9H765 288 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 C20orf141Q9NUB4 165 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FLRT3Q9NZU0 649 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GRID1Q9ULK0 1009 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 YIPF1Q9Y548 306 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PTCH1Q13635 1447 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CHD4Q14839 1912 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MYO10Q9HD67 2058 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GAKO14976 1311 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MDN1Q9NU22 5596 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PANO1I0J062 215 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ACKR2O00590 384 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PLPP2O43688 288 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 BUD23O43709 281 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SNAP91O60641 907 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PRDM1O75626 825 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 C9P02748 559 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 VDRP11473 427 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PPM1AP35813 382 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CSNK2BP67870 215 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 EFNB1P98172 346 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CYCSP99999 105 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PLA2G7Q13093 441 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SQLEQ14534 574 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ALG11Q2TAA5 492 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 Q6P435 159 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FAM131BQ86XD5 332 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PM20D2Q8IYS1 436 aa0.35□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms