RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511129.2

SCARB2-205, Transcript of scavenger receptor class B member 2, humanhuman

TSL 2

Gene SCARB2, Length 860 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2-205ENST00000511129 NTSR2O95665 410 aa5□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 UQCRHP07919 91 aa5□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 CYP3A4P08684 503 aa5□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 RSPH10BP0C881 870 aa5□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 RARGP13631 454 aa5□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 CAPN2P17655 700 aa5□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 GPD1P21695 349 aa5□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 PCSK6P29122 969 aa5□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 ARHGAP25P42331 645 aa5□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 OR1G1P47890 313 aa5□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 LIG4P49917 911 aa5□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 DGKQP52824 942 aa5□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 HUNKP57058 714 aa5□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 SLC8A3P57103 927 aa5□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 KIAA1024LP59773 190 aa5□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 PRAMEP78395 509 aa5□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 ABATP80404 500 aa5□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 TRAF1Q13077 416 aa5□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP5□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 CYP1B1Q16678 543 aa5□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 KLHL40Q2TBA0 621 aa5□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 P3H1Q32P28 736 aa5□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 ATAD3BQ5T9A4 648 aa5□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 STRIP1Q5VSL9 837 aa5□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 ARHGAP17Q68EM7 881 aa5□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 CEP85Q6P2H3 762 aa5□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 TMEM270Q6UE05 265 aa5□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 RRAGAQ7L523 313 aa5□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 TICAM1Q8IUC6 712 aa5□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 ZNF679Q8IYX0 411 aa5□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 OR8K5Q8NH50 307 aa5□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 GLMPQ8WWB7 406 aa5□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 THRSPQ92748 146 aa5□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 KAT2BQ92831 832 aa5□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 DGAT2Q96PD7 388 aa5□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 TIMP4Q99727 224 aa5□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 TMOD2Q9NZR1 351 aa5□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 CNIH4Q9P003 139 aa5□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 NFU1Q9UMS0 254 aa5□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 C15orf41Q9Y2V0 281 aa5□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 MAB21L2Q9Y586 359 aa5□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 SCN4AP35499 1836 aa5□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 AOX1Q06278 1338 aa4.99□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 TRAV6A0A075B6T7 132 aa4.99□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 A0A0G2JLW4 131 aa4.99□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa4.99□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa4.99□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 ARHGEF37A1IGU5 675 aa4.99□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 OR6C74A6NCV1 312 aa4.99□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 GAGE10A6NGK3 116 aa4.99□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 MYO1GB0I1T2 1018 aa4.99□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa4.99□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 PPEF2O14830 753 aa4.99□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 MGST3O14880 152 aa4.99□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 SPRY2O43597 315 aa4.99□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP4.99□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 CTAG2O75638 210 aa4.99□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 PSMD10O75832 226 aa4.99□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 FLOT1O75955 427 aa4.99□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 SEC14L2O76054 403 aa4.99□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 OTCP00480 354 aa4.99□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 ANXA8P13928 327 aa4.99□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 DRD4P21917 467 aa4.99□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 PTPN4P29074 926 aa4.99□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 GGT5P36269 586 aa4.99□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 CCR10P46092 362 aa4.99□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 GSTM5P46439 218 aa4.99□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 HAAOP46952 286 aa4.99□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 NRIP1P48552 1158 aa4.99□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 CLCN4P51793 760 aa4.99□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 CLCNKAP51800 687 aa4.99□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 NAGLUP54802 743 aa4.99□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 PRRX1P54821 245 aa4.99□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 PLTPP55058 493 aa4.99□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 SNU13P55769 128 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 TUBA1BP68363 451 aa4.99□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 TFAP4Q01664 338 aa4.99□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 ALCAMQ13740 583 aa4.99□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 LAMB3Q13751 1172 aa4.99□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 PDIA5Q14554 519 aa4.99□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 ACOX1Q15067 660 aa4.99□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 LIN9Q5TKA1 542 aa4.99□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 ANXA8L1Q5VT79 327 aa4.99□□□□□ -1.61
SCARB2-205ENST00000511129 LIPMQ5VYY2 423 aa4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms