RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508652.5

TMA16-205, Transcript of translation machinery associated 16 homolog, human

TSL 2

Gene TMA16, Length 1,195 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMA16-205	ENST00000508652	ZWINT	O95229	277 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	RBP1	P09455	135 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	ACP5	P13686	325 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	RPA3	P35244	121 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	GMPR	P36959	345 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	HK3	P52790	923 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	SLC18A1	P54219	525 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	PPP2R2A	P63151	447 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	DLG1	Q12959	904 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	RPA4	Q13156	261 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	LRP8	Q14114	963 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	GBX1	Q14549	363 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	ACAP2	Q15057	778 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	PLA2G4E	Q3MJ16	856 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	ZNF658B	Q4V348	819 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	PARG	Q86W56	976 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	SYT12	Q8IV01	421 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	SPNS2	Q8IVW8	549 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	CENPL	Q8N0S6	344 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	PLD6	Q8N2A8	252 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	SKA2	Q8WVK7	121 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	PIGK	Q92643	395 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	PDXP	Q96GD0	296 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	COG4	Q9H9E3	785 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	NKIRAS1	Q9NYS0	192 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	PILRB	Q9UKJ0	227 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	ACSL5	Q9ULC5	683 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	DNAJC16	Q9Y2G8	782 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	PLLP	Q9Y342	182 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	CCDC189	A1A4V9	331 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652		H3BM21	787 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	TM9SF1	O15321	606 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	TSPAN12	O95859	305 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	MPC1L	P0DKB6	136 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	CTSE	P14091	401 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	CD1D	P15813	335 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	NR1D1	P20393	614 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	OAS2	P29728	719 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	NXPH1	P58417	271 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	DMPK	Q09013	629 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	NFE2L1	Q14494	772 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	CCDC153	Q494R4	210 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	ZNF542P	Q5EBM4	170 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	METRNL	Q641Q3	311 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	C16orf46	Q6P387	395 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	LAYN	Q6UX15	382 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	CYHR1	Q6ZMK1	362 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	CDHR3	Q6ZTQ4	885 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	TCP10L	Q8TDR4	215 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	GLMN	Q92990	594 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	GPR78	Q96P69	363 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	MRPL57	Q9BQC6	102 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	DPEP2	Q9H4A9	486 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	TFB2M	Q9H5Q4	396 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	ZNF358	Q9NW07	568 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	TMEM216	Q9P0N5	145 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	GULP1	Q9UBP9	304 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	TSR3	Q9UJK0	312 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	CDYL	Q9Y232	598 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	PLXNB3	Q9ULL4	1909 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	ABCA7	Q8IZY2	2146 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	DOCK9	Q9BZ29	2069 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	BTN3A1	O00481	513 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	SCAMP1	O15126	338 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	ZBTB14	O43829	449 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	JUND	P17535	347 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	TFEB	P19484	476 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	IDS	P22304	550 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	HOXD12	P35452	270 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	MAPK9	P45984	424 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	PREP	P48147	710 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	GLRB	P48167	497 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	CLCNKA	P51800	687 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	CTBS	Q01459	385 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	ABR	Q12979	859 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	MPP2	Q14168	576 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	ZC3H14	Q6PJT7	736 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	PIWIL4	Q7Z3Z4	852 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	RABEPK	Q7Z6M1	372 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	ISCA2	Q86U28	154 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	VRK3	Q8IV63	474 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	PHACTR4	Q8IZ21	702 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	SLC22A15	Q8IZD6	547 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	LILRA3	Q8N6C8	439 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	CCDC63	Q8NA47	563 aa		13.91	□□□□□ -0.18

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