RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507692.5

SNHG4-205, Transcript of small nucleolar RNA host gene 4, human

TSL 5

Gene SNHG4, Length 575 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleoplasm .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG4-205	ENST00000507692	PYGB	P11216	843 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	MLN	P12872	115 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	BRAF	P15056	766 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	AMD1	P17707	334 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	PAM	P19021	973 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	MGAT1	P26572	445 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	NMBR	P28336	390 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	CASQ1	P31415	396 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	CSF2RB	P32927	897 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	MAPK9	P45984	424 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	LIMK2	P53671	638 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	PCBP4	P57723	403 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	ERVPABLB-1	P60509	514 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	ETF1	P62495	437 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	ZFP36L1	Q07352	338 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	GTF3C1	Q12789	2109 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	RPA4	Q13156	261 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	TRA2A	Q13595	282 aa	Known RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	PTK6	Q13882	451 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	GPR18	Q14330	331 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	CLCA4	Q14CN2	919 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	PLCL1	Q15111	1095 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	RPE65	Q16518	533 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	KCTD19	Q17RG1	926 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	ANKRD22	Q5VYY1	191 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	CASC4	Q6P4E1	433 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	CERS6	Q6ZMG9	384 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	ZNF574	Q6ZN55	896 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	LRRC69	Q6ZNQ3	347 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	TMEM26	Q6ZUK4	368 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	ZNF534	Q76KX8	674 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	TMPRSS9	Q7Z410	1059 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	PCGF5	Q86SE9	256 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	CAND1	Q86VP6	1230 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	CREG2	Q8IUH2	290 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	CFAP206	Q8IYR0	622 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	CLDN19	Q8N6F1	224 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	OTUD6B	Q8N6M0	293 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	MCU	Q8NE86	351 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	GPR150	Q8NGU9	434 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	SNIP1	Q8TAD8	396 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	NAT14	Q8WUY8	206 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	CPT1B	Q92523	772 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	NCSTN	Q92542	709 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	FGF11	Q92914	225 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	SLCO2A1	Q92959	643 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	CCDC74B	Q96LY2	380 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	C12orf66	Q96MD2	445 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	SLC46A1	Q96NT5	459 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	SERPINB12	Q96P63	405 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	CMKLR1	Q99788	373 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	KIFC1	Q9BW19	673 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	TSSK1B	Q9BXA7	367 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	WWP1	Q9H0M0	922 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	SEMA6C	Q9H3T2	930 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	COG4	Q9H9E3	785 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	ASCL3	Q9NQ33	180 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	CHRAC1	Q9NRG0	131 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	THSD1	Q9NS62	852 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	TREX1	Q9NSU2	369 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	NEU2	Q9Y3R4	380 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	LOXL2	Q9Y4K0	774 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	COLEC10	Q9Y6Z7	277 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	MN1	Q10571	1320 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	SPTA1	P02549	2419 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	SMG1	Q96Q15	3661 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	FAM237B	A0A1B0GVD1	139 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692		A0A1W2PNU3	283 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	UBA6	A0AVT1	1052 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692		A8MU76	341 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	CDRT15L2	A8MXV6	281 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	AGRP	O00253	132 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	TAF4	O00268	1085 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	IFRD1	O00458	451 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	DNALI1	O14645	258 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	PRMT5	O14744	637 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	NDC80	O14777	642 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	LIN7A	O14910	233 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	RRP8	O43159	456 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	OR1I1	O60431	355 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	AVIL	O75366	819 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	NDUFS3	O75489	264 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	USP1	O94782	785 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	VAPB	O95292	243 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	HGF	P14210	728 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	HOXB3	P14651	431 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	TYRP1	P17643	537 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	MPST	P25325	297 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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