RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489337.5

SMTN-218, Transcript of smoothelin, humanhuman

TSL 2

Gene SMTN, Length 3,560 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTN-218ENST00000489337 CST5P28325 142 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
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SMTN-218ENST00000489337 FPGSQ05932 587 aa11.6□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 TWF1Q12792 350 aa11.6□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP11.6□□□□□ -0.551e-6■■■■□ 22.1
SMTN-218ENST00000489337 LRRC73Q5JTD7 316 aa11.6□□□□□ -0.55
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SMTN-218ENST00000489337 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP11.6□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
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SMTN-218ENST00000489337 C19orf60Q96EN9 201 aa11.6□□□□□ -0.55
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SMTN-218ENST00000489337 TXNDC15Q96J42 360 aa11.6□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 C3orf30Q96M34 536 aa11.6□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 NODALQ96S42 347 aa11.6□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 VAT1Q99536 393 aa11.6□□□□□ -0.55
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SMTN-218ENST00000489337 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
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SMTN-218ENST00000489337 NTHL1P78549 312 aa11.6□□□□□ -0.55
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SMTN-218ENST00000489337 NFYCQ13952 458 aa11.6□□□□□ -0.55
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SMTN-218ENST00000489337 E2F2Q14209 437 aa11.6□□□□□ -0.55
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SMTN-218ENST00000489337 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
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SMTN-218ENST00000489337 AKTIPQ9H8T0 292 aa11.6□□□□□ -0.55
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SMTN-218ENST00000489337 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa11.6□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 DSEQ9UL01 958 aa11.6□□□□□ -0.55
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SMTN-218ENST00000489337 A8MT66 165 aa11.59□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 EOMESO95936 686 aa11.59□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 OR1E1P30953 314 aa11.59□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 CCR1P32246 355 aa11.59□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 ALDH3A2P51648 485 aa11.59□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 DNAJB13P59910 316 aa11.59□□□□□ -0.55
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SMTN-218ENST00000489337 DGCR6Q14129 220 aa11.59□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP11.59□□□□□ -0.55
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SMTN-218ENST00000489337 CTNNB1P35222 781 aa11.59□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 ADPRMQ3LIE5 342 aa11.59□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 XKR4Q5GH76 650 aa11.59□□□□□ -0.55
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SMTN-218ENST00000489337 MUL1Q969V5 352 aa11.59□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 TMBIM1Q969X1 311 aa11.59□□□□□ -0.55
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SMTN-218ENST00000489337 C11orf49Q9H6J7 331 aa11.59□□□□□ -0.55
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SMTN-218ENST00000489337 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP11.59□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 USP3Q9Y6I4 520 aa11.59□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 A0A1W2PRU2 124 aa11.59□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 CCDC85CA6NKD9 419 aa11.59□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 H0Y858 1186 aa11.59□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 TBX1O43435 398 aa11.59□□□□□ -0.55
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SMTN-218ENST00000489337 F9P00740 461 aa11.59□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 CHRNB1P11230 501 aa11.59□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 CES1P23141 567 aa11.59□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 GP2P55259 537 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
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