RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 CDRT15Q96T59 188 aa4.83□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 WACQ9BTA9 647 aa4.83□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 TRPV4Q9HBA0 871 aa4.83□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 CD93Q9NPY3 652 aa4.83□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 ADPRHL2Q9NX46 363 aa4.83□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 TAS2R14Q9NYV8 317 aa4.83□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 COQ3Q9NZJ6 369 aa4.83□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 WDR35Q9P2L0 1181 aa4.83□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 GAGE2DQ9UEU5 116 aa4.83□□□□□ -1.64
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CCL20-204ENST00000489160 POMT1Q9Y6A1 747 aa4.83□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
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CCL20-204ENST00000489160 TRBC2A0A5B9 178 aa4.82□□□□□ -1.64
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CCL20-204ENST00000489160 H0YIN7 160 aa4.82□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 SLC16A5O15375 505 aa4.82□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 B3GALNT1O75752 331 aa4.82□□□□□ -1.64
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CCL20-204ENST00000489160 FYNP06241 537 aa4.82□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa4.82□□□□□ -1.64
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CCL20-204ENST00000489160 COG7P83436 770 aa4.82□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 SCN1BQ07699 218 aa4.82□□□□□ -1.64
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CCL20-204ENST00000489160 ZNF234Q14588 700 aa4.82□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 TNIP1Q15025 636 aa4.82□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 SLC39A14Q15043 492 aa4.82□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 KIF19Q2TAC6 998 aa4.82□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 TMEM35AQ53FP2 167 aa4.82□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 PLBD1Q6P4A8 553 aa4.82□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 CNSTQ6PJW8 725 aa4.82□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 GFRALQ6UXV0 394 aa4.82□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa4.82□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 ODF3L1Q8IXM7 274 aa4.82□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 LPGAT1Q92604 370 aa4.82□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 PTERQ96BW5 349 aa4.82□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 PKNOX2Q96KN3 472 aa4.82□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 MARK4Q96L34 752 aa4.82□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 DGAT2Q96PD7 388 aa4.82□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 MEIS3Q99687 375 aa4.82□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 ACAT2Q9BWD1 397 aa4.82□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 ANKRD2Q9GZV1 360 aa4.82□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 HIPK2Q9H2X6 1198 aa4.82□□□□□ -1.64
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CCL20-204ENST00000489160 KCNS2Q9ULS6 477 aa4.82□□□□□ -1.64
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CCL20-204ENST00000489160 TRAV34A0A0B4J273 112 aa4.81□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa4.81□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 H0YAE9 185 aa4.81□□□□□ -1.64
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CCL20-204ENST00000489160 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 PTAFRP25105 342 aa4.81□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 TNFRSF8P28908 595 aa4.81□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 KIF5BP33176 963 aa4.81□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 KRT2P35908 639 aa4.81□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 ALDH3A2P51648 485 aa4.81□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 BPIFB3P59826 476 aa4.81□□□□□ -1.64
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CCL20-204ENST00000489160 SMU1Q2TAY7 513 aa4.81□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 LETM2Q2VYF4 491 aa4.81□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa4.81□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 CST9LP1Q5W188 147 aa4.81□□□□□ -1.64
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CCL20-204ENST00000489160 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 Q75L30 129 aa4.81□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 ADCK2Q7Z695 626 aa4.81□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 SATL1Q86VE3 508 aa4.81□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 TMPRSS12Q86WS5 348 aa4.81□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 SFR1Q86XK3 245 aa4.81□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 TMEM219Q86XT9 240 aa4.81□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 NAT8LQ8N9F0 302 aa4.81□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 TBC1D16Q8TBP0 767 aa4.81□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 GRK7Q8WTQ7 553 aa4.81□□□□□ -1.64
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