RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486357.1

APOBEC3G-206, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3G, humanhuman

TSL 4

Gene APOBEC3G, Length 543 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3G-206ENST00000486357 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 VPS51Q9UID3 782 aa7.14□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 RCOR1Q9UKL0 485 aa7.14□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 HS3ST2Q9Y278 367 aa7.14□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 FADS3Q9Y5Q0 445 aa7.14□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 HS3ST4Q9Y661 456 aa7.14□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 TENM4Q6N022 2769 aa7.14□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 CFAP46Q8IYW2 2715 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 A0A0D9SEW6 157 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 A0A0G2JNJ9 132 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 LMO7DNF2Z398 122 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 RNF103O00237 685 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 CNTN5O94779 1100 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 IGLV3-25P01717 112 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 GP1BBP13224 206 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 ITGB7P26010 798 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 CNTFP26441 200 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 OR1E1P30953 314 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 USP8P40818 1118 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 PRCPP42785 496 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 PDX1P52945 283 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 YBX1P67809 324 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 CCL7P80098 99 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 PPARDQ03181 441 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 MTA1Q13330 715 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 CTBP1Q13363 440 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 EFHC1Q5JVL4 640 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 TPRG1LQ5T0D9 272 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 ANKRD40Q6AI12 368 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 C22orf39Q6P5X5 142 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 RD3Q7Z3Z2 195 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 VPS36Q86VN1 386 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZFAND4Q86XD8 727 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 CPOQ8IVL8 374 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 ESX1Q8N693 406 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 OR56A3Q8NH54 315 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 STON2Q8WXE9 905 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 SLC35C1Q96A29 364 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 EID2BQ96D98 161 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 PSMB7Q99436 277 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 FAM167BQ9BTA0 163 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 Q9UFV3 132 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 GPR34Q9UPC5 381 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 CTNND2Q9UQB3 1225 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 LOXL2Q9Y4K0 774 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 OR51B4Q9Y5P0 310 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 ACTL7AQ9Y615 435 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 DOCK9Q9BZ29 2069 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 A6NCN8 305 aa7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 TRIM49BA6NDI0 452 aa7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 D6RAR5 112 aa7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 NVLO15381 856 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 NOBOXO60393 691 aa7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 HSF2BPO75031 334 aa7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 SRGAP2O75044 1071 aa7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 ITGA10O75578 1167 aa7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZNF202O95125 648 aa7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 ALPIP09923 528 aa7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 SBK3P0C264 359 aa7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 ITIH1P19827 911 aa7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 RPL34P49207 117 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 CARSP49589 748 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 BLKP51451 505 aa7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 WNT3AP56704 352 aa7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 DOC2BQ14184 412 aa7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 ELOCQ15369 112 aa7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 TOMM20Q15388 145 aa7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 IGFBP7Q16270 282 aa7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 TIGD6Q17RP2 521 aa7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 CARD16Q5EG05 197 aa7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 BORAQ6PGQ7 559 aa7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 RNF44Q7L0R7 432 aa7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 TMEM110Q86TL2 294 aa7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZSCAN30Q86W11 494 aa7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 ARHGEF19Q8IW93 802 aa7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 ARL10Q8N8L6 244 aa7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 DCAF4L2Q8NA75 395 aa7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 KYQ8NBH2 561 aa7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 OR6K2Q8NGY2 324 aa7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZNF606Q8WXB4 792 aa7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 ERP27Q96DN0 273 aa7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3G-206ENST00000486357 CMKLR1Q99788 373 aa7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms