RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483881.1

PKP4-212, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 2

Gene PKP4, Length 452 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-212ENST00000483881 GCKP35557 465 aa3.09□□□□□ -1.91
PKP4-212ENST00000483881 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
PKP4-212ENST00000483881 ARHGAP25P42331 645 aa3.09□□□□□ -1.91
PKP4-212ENST00000483881 DPP6P42658 865 aa3.09□□□□□ -1.91
PKP4-212ENST00000483881 LIFRP42702 1097 aa3.09□□□□□ -1.91
PKP4-212ENST00000483881 TUFMP49411 452 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
PKP4-212ENST00000483881 ENTPD1P49961 510 aa3.09□□□□□ -1.91
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PKP4-212ENST00000483881 RAD23BP54727 409 aa3.09□□□□□ -1.91
PKP4-212ENST00000483881 SSTP61278 116 aa3.09□□□□□ -1.91
PKP4-212ENST00000483881 GSTO1P78417 241 aa3.09□□□□□ -1.91
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PKP4-212ENST00000483881 C17orf67Q0P5P2 114 aa3.09□□□□□ -1.91
PKP4-212ENST00000483881 ST3GAL1Q11201 340 aa3.09□□□□□ -1.91
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PKP4-212ENST00000483881 GPS2Q13227 327 aa3.09□□□□□ -1.91
PKP4-212ENST00000483881 ITGA7Q13683 1181 aa3.09□□□□□ -1.91
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PKP4-212ENST00000483881 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
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PKP4-212ENST00000483881 XKR3Q5GH77 459 aa3.09□□□□□ -1.91
PKP4-212ENST00000483881 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
PKP4-212ENST00000483881 FAM69AQ5T7M9 428 aa3.09□□□□□ -1.91
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PKP4-212ENST00000483881 SHC4Q6S5L8 630 aa3.09□□□□□ -1.91
PKP4-212ENST00000483881 SLC22A25Q6T423 547 aa3.09□□□□□ -1.91
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PKP4-212ENST00000483881 ZYG11AQ6WRX3 759 aa3.09□□□□□ -1.91
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PKP4-212ENST00000483881 C12orf56Q8IXR9 622 aa3.09□□□□□ -1.91
PKP4-212ENST00000483881 FAM217AQ8IXS0 508 aa3.09□□□□□ -1.91
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PKP4-212ENST00000483881 OR8K3Q8NH51 312 aa3.09□□□□□ -1.91
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PKP4-212ENST00000483881 TMIGD2Q96BF3 282 aa3.09□□□□□ -1.91
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PKP4-212ENST00000483881 TMEM5Q9Y2B1 443 aa3.09□□□□□ -1.91
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PKP4-212ENST00000483881 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP3.09□□□□□ -1.918e-9■■■■□ 21.4
PKP4-212ENST00000483881 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa3.09□□□□□ -1.91
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PKP4-212ENST00000483881 LOC100653049A0A140TA62 436 aa3.08□□□□□ -1.92
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PKP4-212ENST00000483881 HEATR9A2RTY3 570 aa3.08□□□□□ -1.92
PKP4-212ENST00000483881 CTAGE9A4FU28 777 aa3.08□□□□□ -1.92
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PKP4-212ENST00000483881 USP17L23D6RBM5 183 aa3.08□□□□□ -1.92
PKP4-212ENST00000483881 H0YIV9 168 aa3.08□□□□□ -1.92
PKP4-212ENST00000483881 HSPB6O14558 160 aa3.08□□□□□ -1.92
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