RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481211.1

NISCH-208, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 557 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-208ENST00000481211 CCNFP41002 786 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 ATP6V0D1P61421 351 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP12.79□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 FAM83EQ2M2I3 478 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 KIF19Q2TAC6 998 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 TRIM61Q5EBN2 209 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 PLA2G2CQ5R387 149 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 KLC3Q6P597 504 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 LVRNQ6Q4G3 990 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 GKN2Q86XP6 184 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 CEP97Q8IW35 865 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 SLC22A15Q8IZD6 547 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 AVL9Q8NBF6 648 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 SUMF1Q8NBK3 374 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 UBXN10Q96LJ8 280 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 SMC6Q96SB8 1091 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 DERL2Q9GZP9 239 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 MED4Q9NPJ6 270 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 KLC4Q9NSK0 619 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 DCDC2Q9UHG0 476 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 NEMP2A6NFY4 417 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 OR5K4A6NMS3 321 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 ARHGAP33O14559 1287 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 KLHL2O95198 593 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 RPN2P04844 631 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 CFIP05156 583 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 CCT5P48643 541 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 CTBSQ01459 385 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 SLC18A2Q05940 514 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 HSPA14Q0VDF9 509 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 GRIK2Q13002 908 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 SP140Q13342 867 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 HSP90B2PQ58FF3 399 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 PAQR3Q6TCH7 311 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 RD3Q7Z3Z2 195 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 CMC1Q7Z7K0 106 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 CFAP206Q8IYR0 622 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 CYP4X1Q8N118 509 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 MYO1HQ8N1T3 1032 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 ACVR1CQ8NER5 493 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 GIMAP7Q8NHV1 300 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 FOPNLQ96NB1 174 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 TMEM168Q9H0V1 697 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 CENPHQ9H3R5 247 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 CAB39LQ9H9S4 337 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 NMRAL1Q9HBL8 299 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 GULP1Q9UBP9 304 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 SLC23A2Q9UGH3 650 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 CDYLQ9Y232 598 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 SNX11Q9Y5W9 270 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 A0A0C4DFX4 3053 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-208ENST00000481211 A0A1B0GTQ1 180 aa12.77□□□□□ -0.37
NISCH-208ENST00000481211 LMO7DNF2Z398 122 aa12.77□□□□□ -0.37
NISCH-208ENST00000481211 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.37
NISCH-208ENST00000481211 SLC16A5O15375 505 aa12.77□□□□□ -0.37
NISCH-208ENST00000481211 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
NISCH-208ENST00000481211 AQP9O43315 295 aa12.77□□□□□ -0.37
NISCH-208ENST00000481211 GLRA3O75311 464 aa12.77□□□□□ -0.37
NISCH-208ENST00000481211 PIAS2O75928 621 aa12.77□□□□□ -0.37
NISCH-208ENST00000481211 C8GP07360 202 aa12.77□□□□□ -0.37
NISCH-208ENST00000481211 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
NISCH-208ENST00000481211 SLC35G4P0C7Q5 338 aa12.77□□□□□ -0.37
NISCH-208ENST00000481211 ZNF883P0CG24 379 aa12.77□□□□□ -0.37
NISCH-208ENST00000481211 CCDC166P0CW27 439 aa12.77□□□□□ -0.37
NISCH-208ENST00000481211 PYGBP11216 843 aa12.77□□□□□ -0.37
NISCH-208ENST00000481211 ITGB6P18564 788 aa12.77□□□□□ -0.37
NISCH-208ENST00000481211 KRT4P19013 534 aa12.77□□□□□ -0.37
NISCH-208ENST00000481211 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.37
NISCH-208ENST00000481211 CRHR1P34998 444 aa12.77□□□□□ -0.37
NISCH-208ENST00000481211 HALP42357 657 aa12.77□□□□□ -0.37
NISCH-208ENST00000481211 BNC1Q01954 994 aa12.77□□□□□ -0.37
NISCH-208ENST00000481211 NFE2L1Q14494 772 aa12.77□□□□□ -0.37
NISCH-208ENST00000481211 ACAP2Q15057 778 aa12.77□□□□□ -0.37
NISCH-208ENST00000481211 UAP1L1Q3KQV9 507 aa12.77□□□□□ -0.37
NISCH-208ENST00000481211 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa12.77□□□□□ -0.37
NISCH-208ENST00000481211 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa12.77□□□□□ -0.37
NISCH-208ENST00000481211 LAYNQ6UX15 382 aa12.77□□□□□ -0.37
NISCH-208ENST00000481211 UNC5DQ6UXZ4 953 aa12.77□□□□□ -0.37
NISCH-208ENST00000481211 SH2D5Q6ZV89 423 aa12.77□□□□□ -0.37
NISCH-208ENST00000481211 CLEC14AQ86T13 490 aa12.77□□□□□ -0.37
NISCH-208ENST00000481211 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa12.77□□□□□ -0.37
NISCH-208ENST00000481211 PDZD3Q86UT5 571 aa12.77□□□□□ -0.37
NISCH-208ENST00000481211 PIM3Q86V86 326 aa12.77□□□□□ -0.37
NISCH-208ENST00000481211 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
NISCH-208ENST00000481211 CPNE9Q8IYJ1 553 aa12.77□□□□□ -0.37
NISCH-208ENST00000481211 TLCD1Q96CP7 247 aa12.77□□□□□ -0.37
NISCH-208ENST00000481211 LRRC61Q9BV99 259 aa12.77□□□□□ -0.37
NISCH-208ENST00000481211 VPS11Q9H270 941 aa12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.6 ms