RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481115.2

PKP4-211, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 884 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-211ENST00000481115 RORBQ92753 470 aa7.08□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 GTF2H4Q92759 462 aa7.08□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 UFD1Q92890 307 aa7.08□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 NXNL1Q96CM4 212 aa7.08□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 ABHD17AQ96GS6 310 aa7.08□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 HSFY1Q96LI6 401 aa7.08□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 NT5C1BQ96P26 610 aa7.08□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 NODALQ96S42 347 aa7.08□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
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PKP4-211ENST00000481115 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa7.08□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 NRSN2Q9GZP1 204 aa7.08□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 IL22Q9GZX6 179 aa7.08□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 ING2Q9H160 280 aa7.08□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 SLC6A17Q9H1V8 727 aa7.08□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa7.08□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 NTN4Q9HB63 628 aa7.08□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 LRRC4Q9HBW1 653 aa7.08□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 ACP6Q9NPH0 428 aa7.08□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 MED9Q9NWA0 146 aa7.08□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 ING3Q9NXR8 418 aa7.08□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 USE1Q9NZ43 259 aa7.08□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 HCSTQ9UBK5 93 aa7.08□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
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PKP4-211ENST00000481115 PHF11Q9UIL8 331 aa7.08□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 GMEB2Q9UKD1 530 aa7.08□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 ERVW-1Q9UQF0 538 aa7.08□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 CDYLQ9Y232 598 aa7.08□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 BTBD3Q9Y2F9 522 aa7.08□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa7.08□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 CSADQ9Y600 493 aa7.08□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 FKBP7Q9Y680 259 aa7.08□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 A0A075B6Q4 140 aa7.07□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 METTL15A6NJ78 407 aa7.07□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 OR6C65A6NJZ3 312 aa7.07□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 C2orf81A6NN90 581 aa7.07□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 PRSS44E7EML9 344 aa7.07□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa7.07□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 PIK3R2O00459 728 aa7.07□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 ZNF623O75123 536 aa7.07□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 TULP3O75386 442 aa7.07□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 PDE9AO76083 593 aa7.07□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 SRP72O76094 671 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 PIGNO95427 931 aa7.07□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 LSM8O95777 96 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 NPPAP01160 153 aa7.07□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 FTH1P02794 183 aa7.07□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 ALPPP05187 535 aa7.07□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 GNAO1P09471 354 aa7.07□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 TRIM49P0CI25 452 aa7.07□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 TRIM49CP0CI26 452 aa7.07□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 SLURP2P0DP57 97 aa7.07□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 BMP3P12645 472 aa7.07□□□□□ -1.28
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PKP4-211ENST00000481115 HNF4AP41235 474 aa7.07□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 QARSP47897 775 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 CDH13P55290 713 aa7.07□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 NKX3-2P78367 333 aa7.07□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP7.07□□□□□ -1.28
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PKP4-211ENST00000481115 SEMA5AQ13591 1074 aa7.07□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 SF1Q15637 639 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 HADHQ16836 314 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 GPAT3Q53EU6 434 aa7.07□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 B3GNT9Q6UX72 402 aa7.07□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 ATG14Q6ZNE5 492 aa7.07□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 GDPD3Q7L5L3 318 aa7.07□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 CATSPER4Q7RTX7 472 aa7.07□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 DDIASQ8IXT1 998 aa7.07□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 CPNE9Q8IYJ1 553 aa7.07□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 UBE2J2Q8N2K1 259 aa7.07□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 CADM2Q8N3J6 435 aa7.07□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 SVOPLQ8N434 492 aa7.07□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 TMEM145Q8NBT3 493 aa7.07□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 SLC44A5Q8NCS7 719 aa7.07□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 SETD9Q8NE22 299 aa7.07□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 KBTBD8Q8NFY9 601 aa7.07□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 PSMA8Q8TAA3 256 aa7.07□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 DCAF4Q8WV16 495 aa7.07□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 CYGBQ8WWM9 190 aa7.07□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 SNAPC3Q92966 411 aa7.07□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 PTP4A1Q93096 173 aa7.07□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 WNT8BQ93098 351 aa7.07□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 SGK3Q96BR1 496 aa7.07□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 DYNLL2Q96FJ2 89 aa7.07□□□□□ -1.28
PKP4-211ENST00000481115 RADILQ96JH8 1075 aa7.07□□□□□ -1.28
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