RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 CMC1Q7Z7K0 106 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 PIM3Q86V86 326 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 GPBAR1Q8TDU6 330 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 GLMNQ92990 594 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 SMC6Q96SB8 1091 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 VPS11Q9H270 941 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 DPEP2Q9H4A9 486 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 COG4Q9H9E3 785 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 CAPN10Q9HC96 672 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC23A2Q9UGH3 650 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 DCDC2Q9UHG0 476 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 GMEB2Q9UKD1 530 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 SNX11Q9Y5W9 270 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 KNL1Q8NG31 2342 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa9.21□□□□□ -0.93
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SH3BP4-208ENST00000462602 CCDC189A1A4V9 331 aa9.21□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
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SH3BP4-208ENST00000462602 GSTA1P08263 222 aa9.21□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 CCDC166P0CW27 439 aa9.21□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 MPC1LP0DKB6 136 aa9.21□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 PYGBP11216 843 aa9.21□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 KRT4P19013 534 aa9.21□□□□□ -0.94
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SH3BP4-208ENST00000462602 ATP6V0D1P61421 351 aa9.21□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 CTBSQ01459 385 aa9.21□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC18A2Q05940 514 aa9.21□□□□□ -0.94
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SH3BP4-208ENST00000462602 NFE2L1Q14494 772 aa9.21□□□□□ -0.94
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SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF460Q14592 562 aa9.21□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa9.21□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF542PQ5EBM4 170 aa9.21□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 ACSBG2Q5FVE4 666 aa9.21□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 PRRT3Q5FWE3 981 aa9.21□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 KCTD16Q68DU8 428 aa9.21□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 KLC3Q6P597 504 aa9.21□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 WASH2PQ6VEQ5 465 aa9.21□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 TAF8Q7Z7C8 310 aa9.21□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 GKN2Q86XP6 184 aa9.21□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 CPNE9Q8IYJ1 553 aa9.21□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC22A15Q8IZD6 547 aa9.21□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 MYO1HQ8N1T3 1032 aa9.21□□□□□ -0.94
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SH3BP4-208ENST00000462602 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa9.21□□□□□ -0.94
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SH3BP4-208ENST00000462602 DERL2Q9GZP9 239 aa9.21□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM168Q9H0V1 697 aa9.21□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa9.21□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa9.21□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 NMRAL1Q9HBL8 299 aa9.21□□□□□ -0.94
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SH3BP4-208ENST00000462602 TM7SF3Q9NS93 570 aa9.21□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 PCMTD2Q9NV79 361 aa9.21□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 GALPQ9UBC7 116 aa9.21□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM8A1Q9UBU6 413 aa9.21□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 KLF15Q9UIH9 416 aa9.21□□□□□ -0.94
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SH3BP4-208ENST00000462602 ARHGAP33O14559 1287 aa9.2□□□□□ -0.94
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SH3BP4-208ENST00000462602 AQP9O43315 295 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 GLRA3O75311 464 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 PIAS2O75928 621 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 KLHL2O95198 593 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC35G4P0C7Q5 338 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC2A4P14672 509 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 CRHR1P34998 444 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 CCNFP41002 786 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 NBL1P41271 181 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 HALP42357 657 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 PREPP48147 710 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 BNC1Q01954 994 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 CSHL1Q14406 222 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 ACAP2Q15057 778 aa9.2□□□□□ -0.94
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