RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459697.1

RABGGTB-203, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,177 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-203ENST00000459697 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 BEX2Q9BXY8 128 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 ZMYND12Q9H0C1 365 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 BRD8Q9H0E9 1235 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 KCNJ16Q9NPI9 418 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 DMRT3Q9NQL9 472 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 SYBUQ9NX95 663 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 DPP3Q9NY33 737 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 ERVW-1Q9UQF0 538 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 ITIH6Q6UXX5 1313 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 CCDC78A2IDD5 438 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 VWA3AA6NCI4 1184 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 A6NNC1 897 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 PP2D1A8MPX8 630 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 A8MV72 311 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 KLHL41O60662 606 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 TOM1L1O75674 476 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 TOXO94900 526 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 MT-ND3P03897 115 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 HKR1P10072 659 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 PEPDP12955 493 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 UNGP13051 313 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 CYP3A7P24462 503 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 GNA11P29992 359 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 NUMBP49757 651 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 SLC5A3P53794 718 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 SGCGQ13326 291 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 ALG11Q2TAA5 492 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 PRSS57Q6UWY2 283 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 DOK3Q7L591 496 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 CPXM2Q8N436 756 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 KDM1BQ8NB78 822 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 CLEC1AQ8NC01 280 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 PIK3C3Q8NEB9 887 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 BICD2Q8TD16 824 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 COG1Q8WTW3 980 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 OR8D1Q8WZ84 308 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 PERPQ96FX8 193 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 FCRL4Q96PJ5 515 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 TAAR6Q96RI8 345 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 POFUT1Q9H488 388 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 PRDM13Q9H4Q3 707 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 CDH9Q9ULB4 789 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 SNX7Q9UNH6 387 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 L3MBTL1Q9Y468 752 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 SNX9Q9Y5X1 595 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 GTF3C1Q12789 2109 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 SEC16AO15027 2179 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 DNAH1Q9P2D7 4330 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 USF3Q68DE3 2245 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 RASA4BC9J798 803 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 CLDN5O00501 218 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 RASA4O43374 803 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 CD5LO43866 347 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 PRAMEF2O60811 474 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 DNAJB6O75190 326 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 LYPLA2O95372 231 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 MATN4O95460 622 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 MUTP22033 750 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 MST1P26927 711 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 CXCR5P32302 372 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 GPR3P46089 330 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 STK19P49842 368 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 GZMKP49863 264 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 SGSHP51688 502 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 NDST2P52849 883 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 SEC24CP53992 1094 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 PEX3P56589 373 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 RPS21P63220 83 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 GUCY1B3Q02153 619 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 CD69Q07108 199 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 MCL1Q07820 350 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 LAMB3Q13751 1172 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 TRIM29Q14134 588 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 NAPRTQ6XQN6 538 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 PLXDC1Q8IUK5 500 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 ZBTB2Q8N680 514 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 NCOA7Q8NI08 942 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.9 ms