RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 C1orf54Q8WWF1 131 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 THAP4Q8WY91 577 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 ZDHHC12Q96GR4 267 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 C9orf72Q96LT7 481 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 SLC29A3Q9BZD2 475 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 TWSG1Q9GZX9 223 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 PDE7BQ9NP56 450 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 RAD18Q9NS91 495 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 TBC1D29Q9UFV1 150 aa11.46□□□□□ -0.57
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PRAME-210ENST00000442481 PGDP52209 483 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP11.45□□□□□ -0.58
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PRAME-210ENST00000442481 LRRN4CLQ8ND94 238 aa11.45□□□□□ -0.58
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PRAME-210ENST00000442481 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
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PRAME-210ENST00000442481 FGF5P12034 268 aa11.44□□□□□ -0.58
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PRAME-210ENST00000442481 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 PDPK2PQ6A1A2 396 aa11.44□□□□□ -0.58
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PRAME-210ENST00000442481 FAM151BQ6UXP7 276 aa11.44□□□□□ -0.58
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PRAME-210ENST00000442481 KLHL7Q8IXQ5 586 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 CCDC89Q8N998 374 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 SPATA4Q8NEY3 305 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 TGM7Q96PF1 710 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa11.44□□□□□ -0.58
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PRAME-210ENST00000442481 OR2AG1Q9H205 316 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 TRABDQ9H4I3 376 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 POT1Q9NUX5 634 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 HACD3Q9P035 362 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 TLK1Q9UKI8 766 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
PRAME-210ENST00000442481 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
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