RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440289.6

PTPRJ-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 3,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-202ENST00000440289 PURAQ00577 322 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 MON1AQ86VX9 555 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 LZICQ8WZA0 190 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF599Q96NL3 588 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 ZBTB18Q99592 522 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 NTN4Q9HB63 628 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 WWOXQ9NZC7 414 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 CAPNS1P04632 268 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 IDUAP35475 653 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 DUSP4Q13115 394 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF773Q6PK81 442 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 SPRED1Q7Z699 444 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 DPY30Q9C005 99 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 F5H5T6 163 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 FKBP9O95302 570 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 FGF1P05230 155 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 BCAP31P51572 246 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 TUSC3Q13454 348 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 AQP6Q13520 282 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 FKBP9P1Q75LS8 142 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 PACRGLQ8N7B6 248 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 UBE2FQ969M7 185 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 PYCR2Q96C36 320 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 NSMCE3Q96MG7 304 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 BOCQ9BWV1 1114 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 H0Y858 1186 aa17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 CBFA2T3O75081 653 aa17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 SERPINA1P01009 418 aa17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 C1QCP02747 245 aa17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 ALDH3A2P51648 485 aa17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 DGKEP52429 567 aa17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 FAM117BQ6P1L5 589 aa17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 SPARTQ8N0X7 666 aa17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 PSMA8Q8TAA3 256 aa17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 LOC285556D6RIA3 1793 aa17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 IGLV3-25P01717 112 aa17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 RPL17P18621 184 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 DCKP27707 260 aa17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 HTR1BP28222 390 aa17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 CYP4F2P78329 520 aa17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 CYP4F3Q08477 520 aa17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 LIX1Q8N485 282 aa17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 RNF175Q8N4F7 328 aa17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 ABHD11Q8NFV4 315 aa17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 NDNFQ8TB73 568 aa17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 CD320Q9NPF0 282 aa17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 HPS4Q9NQG7 708 aa17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 ABCB10Q9NRK6 738 aa17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 TLR6Q9Y2C9 796 aa17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 ORC6Q9Y5N6 252 aa17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 FGF4P08620 206 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 PFKLP17858 780 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 HLA-DPA1P20036 260 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 OXCT1P55809 520 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 MADCAM1Q13477 382 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 SERINC3Q13530 473 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 SYT16Q17RD7 645 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 LRRC73Q5JTD7 316 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 OR7A2PQ8NGA2 310 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 ZFP90Q8TF47 636 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 OR52E6Q96RD3 313 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 ROGDIQ9GZN7 287 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 INIPQ9NRY2 104 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 PSME2Q9UL46 239 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 MED16Q9Y2X0 877 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 ADAM23O75077 832 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 CLPXO76031 633 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 PRAMEF12O95522 483 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 NDST3O95803 873 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 JAK1P23458 1154 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 ATP4BP51164 291 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 NCS1P62166 190 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 ADAM17P78536 824 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 TRIM32Q13049 653 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
PTPRJ-202ENST00000440289 CRY1Q16526 586 aa17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms