RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 VLDLRP98155 873 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ACOX1Q15067 660 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 TTLL9Q3SXZ7 439 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SNX29P2Q8IUI4 249 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC22A9Q8IVM8 553 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 RHOXF1Q8NHV9 184 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 BRSK1Q8TDC3 778 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ITCHQ96J02 903 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 GLT1D1Q96MS3 346 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC6A18Q96N87 628 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 WDCPQ9H6R7 721 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ADA2Q9NZK5 511 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 AASSQ9UDR5 926 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 MIA3Q5JRA6 1907 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 M0R082 166 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 TXNDC9O14530 226 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 TAPBPO15533 448 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CDH1P12830 882 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 HLA-DPA1P20036 260 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CD22P20273 847 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CALRP27797 417 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 RYKP34925 604 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ITGA1P56199 1179 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CBX3Q13185 183 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PON2Q15165 354 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CCL14Q16627 93 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 TAF2Q6P1X5 1199 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM150AQ86TG1 271 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF280BQ86YH2 543 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PARP8Q8N3A8 854 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 C9orf16Q9BUW7 83 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 YIPF2Q9BWQ6 316 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 Q9H521 79 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 LATS2Q9NRM7 1088 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 COX16Q9P0S2 106 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 GULP1Q9UBP9 304 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 XPNPEP2O43895 674 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PRKD3O94806 890 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 FGF1P05230 155 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 HMGCLP35914 325 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ETV6P41212 452 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CD86P42081 329 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 DGKQP52824 942 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 IL10RBQ08334 325 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 TRAF2Q12933 501 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 RAPSNQ13702 412 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 MFSD10Q14728 455 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 MAPRE2Q15555 327 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PFKFB4Q16877 469 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CARD16Q5EG05 197 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 AGAP9Q5VTM2 703 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 LGI2Q8N0V4 545 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 NLGN4XQ8N0W4 816 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SNX25Q9H3E2 840 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CLMPQ9H6B4 373 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SCML2Q9UQR0 700 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ALPK3Q96L96 1907 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CA12O43570 354 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 MITFO75030 526 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 OLFM2O95897 454 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 DESP17661 470 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PFKLP17858 780 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ETFBP38117 255 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 RENBPP51606 427 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CXCR4P61073 352 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 B4GALNT1Q00973 533 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 GNA12Q03113 381 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PRKG2Q13237 762 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CYP51A1Q16850 503 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 GPRC6AQ5T6X5 926 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CES5AQ6NT32 575 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SEPT10Q9P0V9 454 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 NDOR1Q9UHB4 597 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 OR2A25A4D2G3 310 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 KCNK2O95069 426 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM157BP0CG42 384 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CTSAP10619 480 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 BMP8BP34820 402 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 LIPAP38571 399 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC6A12P48065 614 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CLK3P49761 638 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
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