RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414620.1

ACTB-202, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-202ENST00000414620 OOSP2Q86WS3 158 aa15.18■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 PPP1R3BQ86XI6 285 aa15.18■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 CFAP206Q8IYR0 622 aa15.18■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 OR2L2Q8NH16 312 aa15.18■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 DESI2Q9BSY9 194 aa15.18■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 RAB33BQ9H082 229 aa15.18■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 CLMPQ9H6B4 373 aa15.18■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 AMFRQ9UKV5 643 aa15.18■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 BSNQ9UPA5 3926 aa15.18■□□□□ 0.02
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ACTB-202ENST00000414620 OR5K3A6NET4 321 aa15.17■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 SUV39H1O43463 412 aa15.17■□□□□ 0.02
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ACTB-202ENST00000414620 KCNC4Q03721 635 aa15.17■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 SEPT6Q14141 434 aa15.17■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 ERV3-1Q14264 604 aa15.17■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 BCL7AQ4VC05 210 aa15.17■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa15.17■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 KLHL35Q6PF15 583 aa15.17■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 NXPE1Q8N323 547 aa15.17■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 FAM71DQ8N9W8 422 aa15.17■□□□□ 0.02
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ACTB-202ENST00000414620 SLC41A2Q96JW4 573 aa15.17■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 PPM1MQ96MI6 270 aa15.17■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 PDE7BQ9NP56 450 aa15.17■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 HRASLS2Q9NWW9 162 aa15.17■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 SLC24A2Q9UI40 661 aa15.17■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 RARRES3Q9UL19 164 aa15.17■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 SPTBP11277 2137 aa15.17■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 OR6C74A6NCV1 312 aa15.16■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa15.16■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 TLCD2A6NGC4 264 aa15.16■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 TERTO14746 1132 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 LDB2O43679 373 aa15.16■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 METTL18O95568 372 aa15.16■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 FURINP09958 794 aa15.16■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 RALBP11234 206 aa15.16■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 PRLHRP49683 370 aa15.16■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 GDF10P55107 478 aa15.16■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 PDE1BQ01064 536 aa15.16■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 KRT33BQ14525 404 aa15.16■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 SKIDA1Q1XH10 827 aa15.16■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 COLEC12Q5KU26 742 aa15.16■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa15.16■□□□□ 0.02
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ACTB-202ENST00000414620 SNX20Q7Z614 316 aa15.16■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 TMEM139Q8IV31 216 aa15.16■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 UBL4BQ8N7F7 174 aa15.16■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 HM13Q8TCT9 377 aa15.16■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 CT55Q8WUE5 264 aa15.16■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 LRRC45Q96CN5 670 aa15.16■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 RUFY1Q96T51 708 aa15.16■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 COPS8Q99627 209 aa15.16■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 ACSL5Q9ULC5 683 aa15.16■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
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ACTB-202ENST00000414620 AGAP14A8MT82 685 aa15.15■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 CFAP99D6REC4 459 aa15.15■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 NTRK1P04629 796 aa15.15■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 CCNYL3P0C7X3 344 aa15.15■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 HADHAP40939 763 aa15.15■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 DNASE1L3Q13609 305 aa15.15■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 POU6F1Q14863 301 aa15.15■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 GPR19Q15760 415 aa15.15■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP15.15■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 KCTD11Q693B1 232 aa15.15■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 CYB5D1Q6P9G0 228 aa15.15■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 TAS2R42Q7RTR8 314 aa15.15■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 TMEM135Q86UB9 458 aa15.15■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 GAS2L3Q86XJ1 694 aa15.15■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 SPC24Q8NBT2 197 aa15.15■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa15.15■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 NRTNQ99748 197 aa15.15■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 TMEM121Q9BTD3 319 aa15.15■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa15.15■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 COG4Q9H9E3 785 aa15.15■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 LHX9Q9NQ69 397 aa15.15■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 SOHLH2Q9NX45 425 aa15.15■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 SEMA5BQ9P283 1151 aa15.15■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa15.15■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa15.15■□□□□ 0.02
ACTB-202ENST00000414620 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa15.14■□□□□ 0.01
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