RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403084.1

CLDN5-201, Transcript of claudin 5, humanhuman

BASIC

Gene CLDN5, Length 2,357 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN5-201ENST00000403084 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 FBXL12Q9NXK8 326 aa21.54■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 HOXC10Q9NYD6 342 aa21.54■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 CLDN5O00501 218 aa21.54■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 MATN3O15232 486 aa21.54■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 HUNKP57058 714 aa21.54■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 DEFA1P59665 94 aa21.54■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 DEFA3P59666 94 aa21.54■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP21.54■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 KEAP1Q14145 624 aa21.54■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa21.54■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 FBXO47Q5MNV8 452 aa21.54■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 SPATC1Q76KD6 591 aa21.54■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 SLC38A4Q969I6 547 aa21.54■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 ARNT2Q9HBZ2 717 aa21.54■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 ERVW-1Q9UQF0 538 aa21.54■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 A0A1W2PQ67 120 aa21.53■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 YJEFN3A6XGL0 299 aa21.53■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 GSTA4O15217 222 aa21.53■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 ZW10O43264 779 aa21.53■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 SNX4O95219 450 aa21.53■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 UROSP10746 265 aa21.53■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 RACK1P63244 317 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 CLEC20AQ6ZU45 233 aa21.53■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 LIMS2Q7Z4I7 341 aa21.53■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 C11orf74Q86VG3 221 aa21.53■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 UBQLNLQ8IYU4 475 aa21.53■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 SLC16A10Q8TF71 515 aa21.53■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 PYCR2Q96C36 320 aa21.53■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 ITCHQ96J02 903 aa21.53■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 ULBP1Q9BZM6 244 aa21.53■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 TKTL2Q9H0I9 626 aa21.53■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 GJD2Q9UKL4 321 aa21.53■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 AKT3Q9Y243 479 aa21.53■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 MAU2Q9Y6X3 613 aa21.53■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 PDZK1P1A8MUH7 402 aa21.53■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 MAFKO60675 156 aa21.53■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 USP2O75604 605 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 RPS17P08708 135 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 PFKLP17858 780 aa21.53■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 CLK1P49759 484 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 SUOXP51687 545 aa21.53■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 OR2B6P58173 313 aa21.53■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 DAOAP59103 153 aa21.53■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 GBX1Q14549 363 aa21.53■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 PAQR9Q6ZVX9 377 aa21.53■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa21.53■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 DPP9Q86TI2 863 aa21.53■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 SYTL1Q8IYJ3 562 aa21.53■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 ZNF540Q8NDQ6 660 aa21.53■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 SPATA33Q96N06 139 aa21.53■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 SIGLEC11Q96RL6 698 aa21.53■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 WDCPQ9H6R7 721 aa21.53■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 SNTG2Q9NY99 539 aa21.53■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 PIRO00625 290 aa21.52■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 SLC4A1P02730 911 aa21.52■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 ALOX12P18054 663 aa21.52■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 CXCR3P49682 368 aa21.52■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa21.52■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 C6orf136Q5SQH8 315 aa21.52■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 ANKS6Q68DC2 871 aa21.52■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 ZNF549Q6P9A3 640 aa21.52■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 SYVN1Q86TM6 617 aa21.52■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 CHPFQ8IZ52 775 aa21.52■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 NLGN4XQ8N0W4 816 aa21.52■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 HCAR2Q8TDS4 363 aa21.52■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 RHNO1Q9BSD3 238 aa21.52■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 MAGIXQ9H6Y5 334 aa21.52■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 POPDC3Q9HBV1 291 aa21.52■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 CNGB3Q9NQW8 809 aa21.52■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 NUDT5Q9UKK9 219 aa21.52■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 KCNH4Q9UQ05 1017 aa21.52■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 C19orf81C9J6K1 198 aa21.52■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 MITFO75030 526 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 F9P00740 461 aa21.52■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 APOA1P02647 267 aa21.52■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 VTNP04004 478 aa21.52■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 CLK3P49761 638 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 SCNN1GP51170 649 aa21.52■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 WNT3AP56704 352 aa21.52■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 ZFP69Q49AA0 526 aa21.52■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 KDELC1Q6UW63 502 aa21.52■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 APPL2Q8NEU8 664 aa21.52■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 ITPAQ9BY32 194 aa21.52■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 AASSQ9UDR5 926 aa21.52■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 LCKP06239 509 aa21.51■■□□□ 1.03
CLDN5-201ENST00000403084 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
CLDN5-201ENST00000403084 IGFBP5P24593 272 aa21.51■■□□□ 1.03
CLDN5-201ENST00000403084 FBXO39Q8N4B4 442 aa21.51■■□□□ 1.03
CLDN5-201ENST00000403084 ANGPTL6Q8NI99 470 aa21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms