RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368916.1

GABPB2-201, Transcript of GA binding protein transcription factor subunit beta 2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene GABPB2, Length 1,680 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB2-201ENST00000368916 SCN1BQ07699 218 aa7.35□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 SLC13A2Q13183 592 aa7.35□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 GPR50Q13585 617 aa7.35□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 PWP1Q13610 501 aa7.35□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 CSHL1Q14406 222 aa7.35□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 SEMA3AQ14563 771 aa7.35□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 TMEM132DQ14C87 1099 aa7.35□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 PPP1R3AQ16821 1122 aa7.35□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 CERCAMQ5T4B2 595 aa7.35□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 CES3Q6UWW8 571 aa7.35□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 RNF165Q6ZSG1 346 aa7.35□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 ARMCX2Q7L311 632 aa7.35□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 TRIM69Q86WT6 500 aa7.35□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 FAM20CQ8IXL6 584 aa7.35□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 CRYBG2Q8N1P7 616 aa7.35□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 CARNMT1Q8N4J0 409 aa7.35□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 GALNT11Q8NCW6 608 aa7.35□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 ZNF540Q8NDQ6 660 aa7.35□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 NDNFQ8TB73 568 aa7.35□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 DNAJB14Q8TBM8 379 aa7.35□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 KCTD13Q8WZ19 329 aa7.35□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 ZNF599Q96NL3 588 aa7.35□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 MBOAT4Q96T53 435 aa7.35□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 ZBTB18Q99592 522 aa7.35□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 OMDQ99983 421 aa7.35□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 TBL1YQ9BQ87 522 aa7.35□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 SLC30A2Q9BRI3 323 aa7.35□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 SLC22A4Q9H015 551 aa7.35□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 ARNT2Q9HBZ2 717 aa7.35□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 CHST12Q9NRB3 414 aa7.35□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 TREX1Q9NSU2 369 aa7.35□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 GIMAP4Q9NUV9 329 aa7.35□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 ACOXLQ9NUZ1 547 aa7.35□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 STUB1Q9UNE7 303 aa7.35□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 LTBP4Q8N2S1 1624 aa7.34□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa7.34□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 SLC35F4A4IF30 521 aa7.34□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 OR5K3A6NET4 321 aa7.34□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 H3BMM5 538 aa7.34□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 GABRDO14764 452 aa7.34□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 TSPAN9O75954 239 aa7.34□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 ALOX12P18054 663 aa7.34□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 SAT1P21673 171 aa7.34□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 HRH2P25021 359 aa7.34□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 AKT1P31749 480 aa7.34□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 ETV3P41162 512 aa7.34□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 PNPLA4P41247 253 aa7.34□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 RGS7P49802 495 aa7.34□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 SULT1E1P49888 294 aa7.34□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 TPI1P60174 286 aa7.34□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa7.34□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 TNK1Q13470 666 aa7.34□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 TAB1Q15750 504 aa7.34□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 MAPK11Q15759 364 aa7.34□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 DDR2Q16832 855 aa7.34□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 CEP78Q5JTW2 689 aa7.34□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 ARMC4Q5T2S8 1044 aa7.34□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 ATG9BQ674R7 924 aa7.34□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 ANKS6Q68DC2 871 aa7.34□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 FAM122CQ6P4D5 195 aa7.34□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 TBPL2Q6SJ96 375 aa7.34□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 GDPD3Q7L5L3 318 aa7.34□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa7.34□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 SNX20Q7Z614 316 aa7.34□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 SYVN1Q86TM6 617 aa7.34□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 IFNEQ86WN2 208 aa7.34□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 ZFAND4Q86XD8 727 aa7.34□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 P3H2Q8IVL5 708 aa7.34□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 CEP97Q8IW35 865 aa7.34□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 ZNF511Q8NB15 262 aa7.34□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 OR2T12Q8NG77 320 aa7.34□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 OR9I1Q8NGQ6 314 aa7.34□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 STAG3L4Q8TBR4 150 aa7.34□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 ZFAND1Q8TCF1 268 aa7.34□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 FOXJ1Q92949 421 aa7.34□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 WNT8BQ93098 351 aa7.34□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 FATE1Q969F0 183 aa7.34□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 AP2M1Q96CW1 435 aa7.34□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 SLC47A1Q96FL8 570 aa7.34□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 TNIP3Q96KP6 325 aa7.34□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 NPY6RQ99463 290 aa7.34□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 SLC39A3Q9BRY0 314 aa7.34□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa7.34□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 ACTR8Q9H981 624 aa7.34□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 MID1IP1Q9NPA3 183 aa7.34□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 MAPRE3Q9UPY8 281 aa7.34□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa7.34□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 ELOVL7A1L3X0 281 aa7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa7.33□□□□□ -1.24
GABPB2-201ENST00000368916 SNTNA6NMZ2 147 aa7.33□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.3 ms