RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366661.8

TTC13-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 13, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC13, Length 3,253 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC13-201ENST00000366661 ARRDC4Q8NCT1 418 aa15.17■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 C7orf57Q8NEG2 295 aa15.17■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 TRIM63Q969Q1 353 aa15.17■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 MSANTD3Q96H12 275 aa15.17■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa15.17■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 MID1IP1Q9NPA3 183 aa15.17■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 QPCTLQ9NXS2 382 aa15.17■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 GMIPQ9P107 970 aa15.17■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 ARHGAP33O14559 1287 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 RGS13O14921 159 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 PRLP01236 227 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 ADORA2BP29275 332 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 RBP5P82980 135 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 TUBA3CQ13748 450 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 ZNF404Q494X3 552 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 BOLA3Q53S33 107 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 TSTD2Q5T7W7 516 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 MFSD14CQ5VZR4 134 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 ZNF544Q6NX49 715 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 A0A0G2JMP0 313 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 C2CD4BA6NLJ0 364 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 TPPPO94811 219 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 THPOP40225 353 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 IL12RB1P42701 662 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 NAB1Q13506 487 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 RAPSNQ13702 412 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 PAGE3Q5JUK9 113 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 OR52K2Q8NGK3 314 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 SOCS4Q8WXH5 440 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 MUL1Q969V5 352 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 CSPG4P5Q96PW8 444 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 CLPBQ9H078 707 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 DPEP3Q9H4B8 488 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 TSPAN16Q9UKR8 245 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 CTDSP2O14595 271 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 PIP5K1BO14986 540 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 SLC22A1O15245 554 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 AIREO43918 545 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 NDST3O95803 873 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 MAGEA3P43357 314 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 FOXA1P55317 472 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 SPANXN2Q5MJ10 180 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 MILR1Q7Z6M3 343 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 FAM217AQ8IXS0 508 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 IPMKQ8NFU5 416 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 HASPINQ8TF76 798 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 PYCR2Q96C36 320 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 DHRS9Q9BPW9 319 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 VPS4AQ9UN37 437 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 HSPB11Q9Y547 144 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 AQP12BA6NM10 295 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 EVPLLA8MZ36 301 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 ASGR1P07306 291 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 ERCC2P18074 760 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 CLCA4Q14CN2 919 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 ZNF470Q6ECI4 717 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 ENPP6Q6UWR7 440 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 AQP12AQ8IXF9 295 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 PHC2Q8IXK0 858 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 CD99L2Q8TCZ2 262 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 TMEM176AQ96HP8 235 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 TLR9Q9NR96 1032 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 FKBP14Q9NWM8 211 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 KCNN3Q9UGI6 736 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 COL1A2P08123 1366 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 SCN1AP35498 2009 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 MED26O95402 600 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 CCNYL3P0C7X3 344 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 GPD2P43304 727 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 ZNF132P52740 706 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 ARHGEF6Q15052 776 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 FAM109AQ8N4B1 249 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 OR8H1Q8NGG4 311 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 TEX37Q96LM6 180 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 ASB7Q9H672 318 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 VWA7Q9Y334 891 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa15.14■□□□□ 0.01
TTC13-201ENST00000366661 CIB4A0PJX0 185 aa15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms