RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355530.6

SPNS3-201, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SPNS3, Length 2,133 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-201ENST00000355530 CACNG1Q06432 222 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 TRAF2Q12933 501 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 TRAF3Q13114 568 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 STK32CQ86UX6 486 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 OR2T12Q8NG77 320 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 GIPC2Q8TF65 315 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF583Q96ND8 569 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 HBEGFQ99075 208 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 A0A1B0GVM2 712 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 CNPP09543 421 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 CKBP12277 381 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 TCF3P15923 654 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 CCNA2P20248 432 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 CST5P28325 142 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 RAB15P59190 212 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 DUSP4Q13115 394 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 ABRAXAS2Q15018 415 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 KIAA0040Q15053 153 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 TTC23Q5W5X9 447 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 THAP5Q7Z6K1 395 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 DENND1CQ8IV53 801 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 CARNMT1Q8N4J0 409 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 MAGED4Q96JG8 741 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 FANCEQ9HB96 536 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 HPS4Q9NQG7 708 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 DNAJB9Q9UBS3 223 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 PKP3Q9Y446 797 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 IQCF5A8MTL0 148 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 G3V2T6 193 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 FFAR2O15552 330 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 ABCB7O75027 752 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 PCNAP12004 261 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 AKT1P31749 480 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 NFATC3Q12968 1075 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 SMU1Q2TAY7 513 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 CWH43Q9H720 699 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 IPPKQ9H8X2 491 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 VAPAQ9P0L0 249 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 GSTA4O15217 222 aa17.93■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 GLUD1P00367 558 aa17.93■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 INHBBP09529 407 aa17.93■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 ATF6P18850 670 aa17.93■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 CD247P20963 164 aa17.93■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 RPL38P63173 70 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 MBTPS1Q14703 1052 aa17.93■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 CST9Q5W186 159 aa17.93■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa17.93■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 CERS6Q6ZMG9 384 aa17.93■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 RNF165Q6ZSG1 346 aa17.93■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 MILR1Q7Z6M3 343 aa17.93■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 SVOPLQ8N434 492 aa17.93■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 RAB2BQ8WUD1 216 aa17.93■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 FIG4Q92562 907 aa17.93■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 PLD4Q96BZ4 506 aa17.93■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 FAM210AQ96ND0 272 aa17.93■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 TOR3AQ9H497 397 aa17.93■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF711Q9Y462 761 aa17.93■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 CCL27Q9Y4X3 112 aa17.93■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 B4GAT1O43505 415 aa17.93■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 RGS14O43566 566 aa17.93■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 DFNA5O60443 496 aa17.93■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 KATNA1O75449 491 aa17.93■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 MATN1P21941 496 aa17.93■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 CRHBPP24387 322 aa17.93■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 SGSHP51688 502 aa17.93■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 CYP4F3Q08477 520 aa17.93■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 NCEH1Q6PIU2 408 aa17.93■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 PDZD8Q8NEN9 1154 aa17.93■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 OR52E4Q8NGH9 312 aa17.93■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 ACDQ96AP0 544 aa17.93■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 TMEM161AQ9NX61 479 aa17.93■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 IL17CQ9P0M4 197 aa17.93■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa17.92■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 C16orf96A6NNT2 1141 aa17.92■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 GPR39O43194 453 aa17.92■□□□□ 0.46
SPNS3-201ENST00000355530 TBC1D4O60343 1298 aa17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms