RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283875.5

GTF2E1-201, Transcript of general transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTF2E1, Length 3,012 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1-201ENST00000283875 EPOP01588 193 aa7.28□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 TPOP07202 933 aa7.28□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 CYP3A4P08684 503 aa7.28□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 HLA-FP30511 346 aa7.28□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 CDH8P55286 799 aa7.28□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 SLC35A2P78381 396 aa7.28□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 CREMQ03060 361 aa7.28□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 CD47Q08722 323 aa7.28□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 GRM7Q14831 915 aa7.28□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 MICAQ29983 383 aa7.28□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 IER5Q5VY09 327 aa7.28□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 BEND4Q6ZU67 534 aa7.28□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 CLEC14AQ86T13 490 aa7.28□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 LIX1Q8N485 282 aa7.28□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 AMER2Q8N7J2 671 aa7.28□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 NIPA2Q8N8Q9 360 aa7.28□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 MBOAT4Q96T53 435 aa7.28□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 NPAS1Q99742 590 aa7.28□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 CHRAC1Q9NRG0 131 aa7.28□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 RGS18Q9NS28 235 aa7.28□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 TMEM39AQ9NV64 488 aa7.28□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 FAM118AQ9NWS6 357 aa7.28□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 HPF1Q9NWY4 346 aa7.28□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 MTMR10Q9NXD2 777 aa7.28□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 ZNF224Q9NZL3 707 aa7.28□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 DERAQ9Y315 318 aa7.28□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 ASB4Q9Y574 426 aa7.28□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 TRAV20A0A0B4J274 112 aa7.27□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 TMEM82A0PJX8 343 aa7.27□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 SLC35F4A4IF30 521 aa7.27□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 PRR23AA6NEV1 266 aa7.27□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 EFCAB9A8MZ26 197 aa7.27□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 B4DXG7 233 aa7.27□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 GCNT3O95395 438 aa7.27□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa7.27□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 DARSP14868 501 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 MAGP20916 626 aa7.27□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 ALDH4A1P30038 563 aa7.27□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 MASP1P48740 699 aa7.27□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 RAB13P51153 203 aa7.27□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 MYL6P60660 151 aa7.27□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 PCDH1Q08174 1060 aa7.27□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 GRIK2Q13002 908 aa7.27□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 TNFAIP1Q13829 316 aa7.27□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 IRF3Q14653 427 aa7.27□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 SGCAQ16586 387 aa7.27□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 TMEM198Q66K66 360 aa7.27□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 PPP1R18Q6NYC8 613 aa7.27□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 TMC8Q8IU68 726 aa7.27□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 RIMKLAQ8IXN7 391 aa7.27□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 SYTL1Q8IYJ3 562 aa7.27□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 GDPD1Q8N9F7 314 aa7.27□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 CDCA5Q96FF9 252 aa7.27□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 SORCS2Q96PQ0 1159 aa7.27□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 TMEM245Q9H330 911 aa7.27□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 ASB7Q9H672 318 aa7.27□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 NDUFAF1Q9Y375 327 aa7.27□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 A0A075B6Q4 140 aa7.27□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa7.27□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 OR2A25A4D2G3 310 aa7.27□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 E5RI56 91 aa7.27□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 TPP1O14773 563 aa7.27□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 RGS5O15539 181 aa7.27□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 FAM13AO94988 1023 aa7.27□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 KRT1P04264 644 aa7.27□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 PTPRAP18433 802 aa7.27□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 TFEBP19484 476 aa7.27□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 CSRP3P50461 194 aa7.27□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 CLCN5P51795 746 aa7.27□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 AIF1P55008 147 aa7.27□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 FCGRTP55899 365 aa7.27□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa7.27□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 DUSP6Q16828 381 aa7.27□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 COL28A1Q2UY09 1125 aa7.27□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 C2CD6Q53TS8 623 aa7.27□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 ZNF691Q5VV52 312 aa7.27□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa7.27□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 GK5Q6ZS86 529 aa7.27□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 C12orf40Q86WS4 652 aa7.27□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 MPP5Q8N3R9 675 aa7.27□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 MINDY1Q8N5J2 469 aa7.27□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 ADAM32Q8TC27 787 aa7.27□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 ACTL9Q8TC94 416 aa7.27□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 KIAA1191Q96A73 305 aa7.27□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 GPRASP2Q96D09 838 aa7.27□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 ARL5BQ96KC2 179 aa7.27□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 CCDC17Q96LX7 622 aa7.27□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa7.27□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 BBS4Q96RK4 519 aa7.27□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 IKZF4Q9H2S9 585 aa7.27□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 IL1RAPQ9NPH3 570 aa7.27□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 GKN1Q9NS71 199 aa7.27□□□□□ -1.25
GTF2E1-201ENST00000283875 EPHA6Q9UF33 1036 aa7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms