RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000228515.5

CSRNP2-201, Transcript of cysteine and serine rich nuclear protein 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSRNP2, Length 4,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP2-201ENST00000228515 UGT1A3P35503 534 aa14.55□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 UGT1A5P35504 534 aa14.55□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 KCNJ11Q14654 390 aa14.55□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 LRRC73Q5JTD7 316 aa14.55□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 COPS4Q9BT78 406 aa14.55□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 C3orf14Q9HBI5 128 aa14.55□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 PSAT1Q9Y617 370 aa14.55□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa14.55□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 A8MT66 165 aa14.55□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 BTN3A3O00478 584 aa14.55□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 C9P02748 559 aa14.55□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 PTGER3P43115 390 aa14.55□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 DGKQP52824 942 aa14.55□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 IL10RBQ08334 325 aa14.55□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 PIK3R6Q5UE93 754 aa14.55□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 IGDCC3Q8IVU1 814 aa14.55□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 SLC9A6Q92581 669 aa14.55□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 CEP295NLQ96MC4 621 aa14.55□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa14.55□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 PLK4O00444 970 aa14.55□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 ZW10O43264 779 aa14.55□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 HCN1O60741 890 aa14.55□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 RYKP34925 604 aa14.55□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 WASP42768 502 aa14.55□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 ENPEPQ07075 957 aa14.55□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 BNIP3Q12983 259 aa14.55□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 IL18Q14116 193 aa14.55□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 TAF13Q15543 124 aa14.55□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 FAM220AQ7Z4H9 259 aa14.55□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 PKP2Q99959 881 aa14.55□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 LRRC3Q9BY71 257 aa14.55□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 COMMD9Q9P000 198 aa14.55□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 MAGEB17A8MXT2 336 aa14.54□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 IRAK2O43187 625 aa14.54□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 ATG13O75143 517 aa14.54□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 DHFRP00374 187 aa14.54□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 ZNF132P52740 706 aa14.54□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 CCDC80Q76M96 950 aa14.54□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 ASB9Q96DX5 294 aa14.54□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 AIF1LQ9BQI0 150 aa14.54□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 PDCD10Q9BUL8 212 aa14.54□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa14.54□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 HLA-DQB2P05538 268 aa14.54□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 RAP2AP10114 183 aa14.54□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 LAMP2P13473 410 aa14.54□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 IMPDH1P20839 514 aa14.54□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 CTNNB1P35222 781 aa14.54□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 NDST2P52849 883 aa14.54□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 ACLYP53396 1101 aa14.54□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 TPTEP56180 551 aa14.54□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 DCST1Q5T197 706 aa14.54□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 EXD2Q9NVH0 621 aa14.54□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 DNAJB4Q9UDY4 337 aa14.54□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 ADAMDEC1O15204 470 aa14.54□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 PRKCGP05129 697 aa14.54□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 CYP3A5P20815 502 aa14.54□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 HTR7P34969 479 aa14.54□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 JAG1P78504 1218 aa14.54□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 SLC18A2Q05940 514 aa14.54□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 RAB43Q86YS6 212 aa14.54□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 TCAIMQ8N3R3 496 aa14.54□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 RAB2BQ8WUD1 216 aa14.54□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 SIGLEC10Q96LC7 697 aa14.54□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 PTPN18Q99952 460 aa14.54□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 MARCH7Q9H992 704 aa14.54□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa14.54□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 GULP1Q9UBP9 304 aa14.54□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 COQ6Q9Y2Z9 468 aa14.54□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 MATN2O00339 956 aa14.53□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 RGS20O76081 388 aa14.53□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 GCNT6Q5T4J0 391 aa14.53□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 FUT10Q6P4F1 479 aa14.53□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa14.53□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 FAM124AQ86V42 546 aa14.53□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 RGL4Q8IZJ4 473 aa14.53□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 SLC43A3Q8NBI5 491 aa14.53□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 LRRC58Q96CX6 371 aa14.53□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa14.53□□□□□ -0.08
CSRNP2-201ENST00000228515 CNTN3Q9P232 1028 aa14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms