RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000223129.8

RPA3-201, Transcript of replication protein A3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPA3, Length 2,020 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3-201ENST00000223129 AOAHP28039 575 aa14.7□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 CDKN2DP55273 166 aa14.7□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 HSPA14Q0VDF9 509 aa14.7□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 CLCA4Q14CN2 919 aa14.7□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 NETO1Q8TDF5 533 aa14.7□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 APOLD1Q96LR9 279 aa14.7□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 TSSK1BQ9BXA7 367 aa14.7□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa14.7□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 SLC5A10A0PJK1 596 aa14.7□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa14.7□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 F3P13726 295 aa14.7□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 SAT1P21673 171 aa14.7□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 GP5P40197 560 aa14.7□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 CLCN7P51798 805 aa14.7□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 HECTD2Q5U5R9 776 aa14.7□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 EMBQ6PCB8 327 aa14.7□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 IYDQ6PHW0 289 aa14.7□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 OGFOD3Q6PK18 319 aa14.7□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 OTOAQ7RTW8 1153 aa14.7□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 VRK3Q8IV63 474 aa14.7□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 SLC35F3Q8IY50 421 aa14.7□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 KYQ8NBH2 561 aa14.7□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 VPS39Q96JC1 886 aa14.7□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 GPR21Q99679 349 aa14.7□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 RBBP8Q99708 897 aa14.7□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 WWP1Q9H0M0 922 aa14.7□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 RHOJQ9H4E5 214 aa14.7□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 CDYLQ9Y232 598 aa14.7□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa14.69□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 KLHL33A6NCF5 533 aa14.69□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 OR52A4PA6NMU1 304 aa14.69□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 CBFA2T3O75081 653 aa14.69□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 TUBBP07437 444 aa14.69□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 ABHD2P08910 425 aa14.69□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 GSTM1P09488 218 aa14.69□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 HSD17B3P37058 310 aa14.69□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 MAZP56270 477 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 GSTM4Q03013 218 aa14.69□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 INAVAQ3KP66 663 aa14.69□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 SYTL3Q4VX76 610 aa14.69□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 GRTP1Q5TC63 336 aa14.69□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa14.69□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 PIM3Q86V86 326 aa14.69□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 GPR156Q8NFN8 814 aa14.69□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 GIMAP7Q8NHV1 300 aa14.69□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 KCNJ9Q92806 393 aa14.69□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 CAVIN3Q969G5 261 aa14.69□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 ELMO2Q96JJ3 720 aa14.69□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 OLFM1Q99784 485 aa14.69□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 OR52A5Q9H2C5 316 aa14.69□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 ACSL5Q9ULC5 683 aa14.69□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 VWA7Q9Y334 891 aa14.69□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 COMMD10Q9Y6G5 202 aa14.69□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa14.68□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa14.68□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 TM4SF5O14894 197 aa14.68□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 GPC4O75487 556 aa14.68□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 NAB1Q13506 487 aa14.68□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 PROX2Q3B8N5 592 aa14.68□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 PIP4P1Q86T03 277 aa14.68□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 ARL10Q8N8L6 244 aa14.68□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 DEFB124Q8NES8 71 aa14.68□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 SLC37A2Q8TED4 501 aa14.68□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 ASZ1Q8WWH4 475 aa14.68□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 TMEM159Q96B96 161 aa14.68□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 LATS2Q9NRM7 1088 aa14.68□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 U3KQA8 63 aa14.68□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa14.68□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 VPS26AO75436 327 aa14.68□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 SHBGP04278 402 aa14.68□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 APOA4P06727 396 aa14.68□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 DNAJC3Q13217 504 aa14.68□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 KLHL38Q2WGJ6 581 aa14.68□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 AGAP9Q5VTM2 703 aa14.68□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 FAM45BPQ6NSW5 357 aa14.68□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 WASH2PQ6VEQ5 465 aa14.68□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 SFRP1Q8N474 314 aa14.68□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 ARL14Q8N4G2 192 aa14.68□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 ZBTB2Q8N680 514 aa14.68□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 FAM181AQ8N9Y4 354 aa14.68□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 FAM45AQ8TCE6 357 aa14.68□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 CD200R1Q8TD46 325 aa14.68□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 RMDN2Q96LZ7 410 aa14.68□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 PAFAH2Q99487 392 aa14.68□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 CAB39LQ9H9S4 337 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms