RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027667.12

Pkp1-201, Transcript of Plakophilin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pkp1, Length 4,669 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tnfaip8l3Q3TBL6 204 aa12.66□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Six3Q62233 333 aa12.66□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Acat3Q80X81 397 aa12.66□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Q8BWQ6 963 aa12.66□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Actr1bQ8R5C5 376 aa12.66□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mul1Q8VCM5 352 aa12.66□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vps4aQ8VEJ9 437 aa12.66□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Wdsub1Q9D0I6 474 aa12.66□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sp2Q9D2H6 612 aa12.66□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Herpud2Q9JJC9 404 aa12.66□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cldn7Q9Z261 211 aa12.66□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mgat4eA6H684 439 aa12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn2r94E9PZK8 818 aa12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm4847G3X946 537 aa12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Stk16O88697 305 aa12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Prf1P10820 554 aa12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 GstcdQ5RL51 634 aa12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pkp4Q68FH0 1190 aa12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Q6P1I3 445 aa12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Maml1Q6T264 1020 aa12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cand1Q6ZQ38 1230 aa12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc6a15Q8BG16 729 aa12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PisdQ8BSF4 406 aa12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Prmt5Q8CIG8 637 aa12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Snrnp27Q8K194 155 aa12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 ClmpQ8R373 373 aa12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Prpf19Q99KP6 504 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lcn9Q9D267 178 aa12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Aqp5Q9WTY4 265 aa12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Net1Q9Z206 595 aa12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mrpl40Q9Z2Q5 206 aa12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Myh7bA2AQP0 1941 aa12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cfap44E9Q5M6 1843 aa12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fbxo47A2A6H3 451 aa12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tubb1A2AQ07 451 aa12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slfn9B1ARD6 910 aa12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm7275E9Q1B3 247 aa12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rgsl1H3BL40 1073 aa12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm17019K7N6W5 255 aa12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm2888K7N746 267 aa12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sypl1O09117 261 aa12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Grb7Q03160 535 aa12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Spire1Q52KF3 598 aa12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Chsy3Q5DTK1 884 aa12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 KdsrQ6GV12 332 aa12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Scn4bQ7M729 228 aa12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1276Q8VF40 312 aa12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hkdc1Q91W97 915 aa12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mgrn1Q9D074 532 aa12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nhsl1Q8CAF4 1587 aa12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Myh8P13542 1937 aa12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 C1dO35473 141 aa12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gh1P06880 216 aa12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pip5k1bP70181 539 aa12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfp78Q5U406 512 aa12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Akt2Q60823 481 aa12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Osgepl1Q6PEB4 414 aa12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gramd1cQ8CI52 457 aa12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 McmbpQ8R3C0 642 aa12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cops8Q8VBV7 209 aa12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm28897A0A087WP44 222 aa12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Chil5A0A0G2JDS2 431 aa12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm6509A0A0J9YUV1 481 aa12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tex28B1AYN9 409 aa12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn2r125D3Z3M1 369 aa12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn2r116E9Q6I0 856 aa12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm6351K9J7D1 481 aa12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Polr2jO08740 117 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sema6aO35464 1031 aa12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cyp2a4P15392 494 aa12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cyp2a5P20852 494 aa12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lman2lP59481 347 aa12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trpv5P69744 723 aa12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Smad5P97454 465 aa12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Bpifa6Q0VGU8 367 aa12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Q14AM7 275 aa12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mthfd1lQ3V3R1 977 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zc3h11aQ6NZF1 792 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 IpmkQ7TT16 396 aa12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Snx32Q80ZJ7 404 aa12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tbl3Q8C4J7 801 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rab36Q8CAM5 267 aa12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr382Q8VF79 312 aa12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cryl1Q99KP3 319 aa12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmem135Q9CYV5 458 aa12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Efcab1Q9D3N2 212 aa12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tle6Q9WVB3 581 aa12.65□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ralgps1A2AR50 585 aa12.64□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gstm1P10649 218 aa12.64□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rb1P13405 921 aa12.64□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Copz1P61924 177 aa12.64□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Eps15l1Q60902 907 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cyp2r1Q6VVW9 501 aa12.64□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fam83eQ80XS7 481 aa12.64□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 GskipQ8BGR8 139 aa12.64□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fam109aQ8BH49 266 aa12.64□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc17a6Q8BLE7 582 aa12.64□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sdhaf3Q8BQU3 125 aa12.64□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 NeproQ8R2U2 564 aa12.64□□□□□ -0.39
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Abcb9Q9JJ59 762 aa12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 22.9 ms