RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628078.2

TCF4-262, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 1,277 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-262	ENST00000628078	SPOP	O43791	374 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	LCA5L	O95447	670 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	AGT	P01019	485 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	MT-ND3	P03897	115 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	GP1BB	P13224	206 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	AKT1	P31749	480 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	ARHGAP25	P42331	645 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	CDKN2B	P42772	138 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	PMS2	P54278	862 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	OLIG2	Q13516	323 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	SEMA5A	Q13591	1074 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	IL10RA	Q13651	578 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	ATCAY	Q86WG3	371 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF567	Q8N184	647 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	LILRA3	Q8N6C8	439 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	SLC38A9	Q8NBW4	561 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	UBXN4	Q92575	508 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	IQCD	Q96DY2	449 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	SLC41A2	Q96JW4	573 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	C12orf66	Q96MD2	445 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	APOL2	Q9BQE5	337 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	FAM96A	Q9H5X1	160 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	NHEJ1	Q9H9Q4	299 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	LRRC4C	Q9HCJ2	640 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	ZNHIT6	Q9NWK9	470 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	TFR2	Q9UP52	801 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	ARL5A	Q9Y689	179 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	MED13	Q9UHV7	2174 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078		A6NL46	340 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	SCRG1	O75711	98 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	POLR2C	P19387	275 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	MSH3	P20585	1137 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	PTPN4	P29074	926 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	RPS15	P62841	145 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	TMPRSS15	P98073	1019 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	GPS2	Q13227	327 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	GSE1	Q14687	1217 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	SLC1A5	Q15758	541 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	C4orf17	Q53FE4	359 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	LDLRAP1	Q5SW96	308 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	ARMC6	Q6NXE6	501 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	CLEC18B	Q6UXF7	455 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	DAAM2	Q86T65	1068 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	TMEM126B	Q8IUX1	230 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	OR4E2	Q8NGC2	313 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF398	Q8TD17	642 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF514	Q96K75	400 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	CCDC42	Q96M95	316 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	DNAJC7	Q99615	494 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	HEMGN	Q9BXL5	484 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	MFRP	Q9BY79	579 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	RAB33B	Q9H082	229 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	KLHL25	Q9H0H3	589 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	SOHLH2	Q9NX45	425 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	DDX56	Q9NY93	547 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	LCMT1	Q9UIC8	334 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	FARSA	Q9Y285	508 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	PKP3	Q9Y446	797 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	PCDHGA6	Q9Y5G7	932 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	SPTB	P11277	2137 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	OR5K3	A6NET4	321 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	SLC9B1P1	A6NJY1	282 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF487	B1APH4	448 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	STX7	O15400	261 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	VPS4B	O75351	444 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	MARCKSL1	P49006	195 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	KPNA2	P52292	529 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	HSD11B2	P80365	405 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	PDE1B	Q01064	536 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	ACY1	Q03154	408 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	KRT33B	Q14525	404 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	METRNL	Q641Q3	311 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	KLHL35	Q6PF15	583 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	RHOT2	Q8IXI1	618 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	CFAP206	Q8IYR0	622 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	P3H4	Q92791	437 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	PSMG3-AS1	Q96PY0	264 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	SLC25A23	Q9BV35	468 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	FICD	Q9BVA6	458 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	TLR10	Q9BXR5	811 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	CHST8	Q9H2A9	424 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	TRABD	Q9H4I3	376 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	ASB8	Q9H765	288 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	ACSS2	Q9NR19	701 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	KCND1	Q9NSA2	647 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	MAP10	Q9P2G4	905 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	RSPH14	Q9UHP6	348 aa		13.17	□□□□□ -0.3

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