RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616768.4

MLH1-223, Transcript of mutL homolog 1, human

TSL 2

Gene MLH1, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLH1-223	ENST00000616768	MC2R	Q01718	297 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	HECTD3	Q5T447	861 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	NRSN1	Q8IZ57	195 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	ST6GALNAC3	Q8NDV1	305 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	FBXO32	Q969P5	355 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	MYLPF	Q96A32	169 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	FEM1C	Q96JP0	617 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	SPATA17	Q96L03	361 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	ALG8	Q9BVK2	526 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	KLK15	Q9H2R5	256 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	RDH14	Q9HBH5	336 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	CHORDC1	Q9UHD1	332 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	LSM7	Q9UK45	103 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	PILRA	Q9UKJ1	303 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	FZD4	Q9ULV1	537 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	SCML1	Q9UN30	329 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	BIRC6	Q9NR09	4857 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	CACNA1C	Q13936	2221 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	PRKDC	P78527	4128 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	MYH11	P35749	1972 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	HIVEP2	P31629	2446 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768		A0A0G2JK05	382 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	TTC26	A0AVF1	554 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768		F8VP50	259 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	PIR	O00625	290 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	MDM4	O15151	490 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	DPM1	O60762	260 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	RNASEH1	O60930	286 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	GCAT	O75600	419 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	DEXI	O95424	95 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	TBX18	O95935	607 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	CSF2	P04141	144 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	GOT1	P17174	413 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	NFKBIA	P25963	317 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	PPP3CC	P48454	512 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	TAF6	P49848	677 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	TUBB3	Q13509	450 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	SEMA5A	Q13591	1074 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	FZD2	Q14332	565 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	MAP9	Q49MG5	647 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	DCAF10	Q5QP82	559 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	SPATA1	Q5VX52	437 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	JADE1	Q6IE81	842 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	GCNT7	Q6ZNI0	430 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	CHST9	Q7L1S5	443 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	PEG10	Q86TG7	708 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	TMEM200A	Q86VY9	491 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	ZC3H3	Q8IXZ2	948 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	RGMA	Q96B86	450 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	CTRC	Q99895	268 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	B3GNT4	Q9C0J1	378 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	MRPL46	Q9H2W6	279 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	AKAP7	Q9P0M2	348 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	L1RE1	Q9UN81	338 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	PLA2G4C	Q9UP65	541 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	CSNK1G3	Q9Y6M4	447 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768		A0A1B0GUH1	482 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	ARGFX	A6NJG6	315 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	CCDC169	A6NNP5	214 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	E2F3	O00716	465 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	TPP1	O14773	563 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	INPP4B	O15327	924 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	ANXA6	P08133	673 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	PPP3CB	P16298	524 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF37A	P17032	561 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	CYP3A7	P24462	503 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	DRD3	P35462	400 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	DLST	P36957	453 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	MAGEA11	P43364	429 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	PGF	P49763	221 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	EFNA5	P52803	228 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	FOXM1	Q08050	763 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	E2F5	Q15329	346 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	TPRG1L	Q5T0D9	272 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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