RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 TSPAN11A1L157 253 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 E7ESA3 106 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 FZD6O60353 706 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 CBFA2T3O75081 653 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 TRBC1P01850 177 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 APOC2P02655 101 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 C1SP09871 688 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 FTH1P19P0C7X4 201 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 HALP42357 657 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 DPP6P42658 865 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 CDKN3Q16667 212 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM52BQ4KMG9 183 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 DPPA4Q7L190 304 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 LILRB2Q8N423 598 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 SKA1Q96BD8 255 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 NUS1Q96E22 293 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 TEKT5Q96M29 485 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM111AQ96PZ2 611 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 SCNM1Q9BWG6 230 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 TRIM55Q9BYV6 548 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 HEY2Q9UBP5 337 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 KLK13Q9UKR3 277 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 ANKRD66B4E2M5 251 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 TM9SF1O15321 606 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 HAUS5O94927 633 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 RASGRP1O95267 797 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 MT-ND3P03897 115 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 TGM2P21980 687 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 SERPINB3P29508 390 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 VIPR1P32241 457 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 ELK3P41970 407 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 WNT3AP56704 352 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 PFN3P60673 137 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF423Q2M1K9 1284 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 IL27RAQ6UWB1 636 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 USP45Q70EL2 814 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 TTC13Q8NBP0 860 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 IFT43Q96FT9 208 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 SCYL1Q96KG9 808 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP12.39□□□□□ -0.437e-6■■□□□ 13
RABGEF1-209ENST00000607882 GORASP1Q9BQQ3 440 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 APOOQ9BUR5 198 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC32A1Q9H598 525 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 ARL8BQ9NVJ2 186 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 FETUBQ9UGM5 382 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 KCTD3Q9Y597 815 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 SOCS5O75159 536 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 TSHRP16473 764 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 TPH1P17752 444 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 BLMHQ13867 455 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 GRM3Q14832 879 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 ALG11Q2TAA5 492 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 PARGQ86W56 976 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 OR1E3Q8WZA6 343 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 AP2M1Q96CW1 435 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 CYTH2Q99418 400 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM168Q9H0V1 697 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 VPS11Q9H270 941 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 TOR4AQ9NXH8 423 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 GULP1Q9UBP9 304 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 IKBKGQ9Y6K9 419 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 CACNA1GO43497 2377 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 URB1O60287 2271 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 CPED1A4D0V7 1026 aa12.38□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP12.38□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 AVILO75366 819 aa12.38□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 PIAS2O75928 621 aa12.38□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 BGNP21810 368 aa12.38□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 AK4P27144 223 aaPredicted RBP12.38□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 ARFIP2P53365 341 aa12.38□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 TMPRSS15P98073 1019 aa12.38□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 CDK18Q07002 472 aa12.38□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP12.38□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM151BQ8IW70 566 aa12.38□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF398Q8TD17 642 aa12.38□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP12.38□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP12.38□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP12.38□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 LRRC61Q9BV99 259 aa12.38□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 FICDQ9BVA6 458 aa12.38□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 SAR1AQ9NR31 198 aa12.38□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa12.38□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 EFR3BQ9Y2G0 817 aa12.38□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 INHBAP08476 426 aa12.38□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 CEACAM1P13688 526 aa12.38□□□□□ -0.43
RABGEF1-209ENST00000607882 RABIFP47224 123 aa12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.1 ms