RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584538.1

USP22-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 22, human

TSL 4

Gene USP22, Length 554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP22-211	ENST00000584538	DUSP3	P51452	185 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	PDX1	P52945	283 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	PLTP	P55058	493 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	ADAR	P55265	1226 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	MPP1	Q00013	466 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	GUCY2D	Q02846	1103 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	CAV1	Q03135	178 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	CLCA4	Q14CN2	919 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	CDCP2	Q5VXM1	449 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	METRNL	Q641Q3	311 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	DHRS13	Q6UX07	377 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	SPRED1	Q7Z699	444 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	ANKMY2	Q8IV38	441 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	GLMN	Q92990	594 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	CFAP36	Q96G28	342 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	OR52A5	Q9H2C5	316 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	C20orf96	Q9NUD7	363 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	INTS10	Q9NVR2	710 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	ZC3H7B	Q9UGR2	993 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	CDYL	Q9Y232	598 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	APOBEC2	Q9Y235	224 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	KIR2DS5	A0A0G2JLQ3	304 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538		A0A0G2JNG1	304 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	C17orf113	A0A1B0GUU1	675 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538		A0A1W2PQM1	296 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	SLC5A10	A0PJK1	596 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	CPED1	A4D0V7	1026 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	OR52A4P	A6NMU1	304 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	KIR2DS3	K7RE56	304 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	QSOX1	O00391	747 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	NTN3	O00634	580 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	PPM1D	O15297	605 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	NUDT21	O43809	227 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	OPA1	O60313	960 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	SNX2	O60749	519 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	FTH1	P02794	183 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	GSTM1	P09488	218 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	ERVK-10	P10266	1014 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	PNLIP	P16233	465 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	VCL	P18206	1134 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	IDS	P22304	550 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	RPL10	P27635	214 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	SLC19A1	P41440	591 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	INSM1	Q01101	510 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	GSTM4	Q03013	218 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	GBX1	Q14549	363 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	KIR2DS5	Q14953	304 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	UBAP2	Q5T6F2	1119 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	ZNF549	Q6P9A3	640 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	LRRC6	Q86X45	466 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	CCNJL	Q8IV13	435 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	SPNS2	Q8IVW8	549 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	LMNTD2	Q8IXW0	634 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	KRT222	Q8N1A0	295 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	OTUD6B	Q8N6M0	293 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	C2CD4A	Q8NCU7	369 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	MAPK15	Q8TD08	544 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	TCF12	Q99081	682 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	CCDC3	Q9BQI4	270 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	CCM2	Q9BSQ5	444 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	FOXP3	Q9BZS1	431 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	FBXO6	Q9NRD1	293 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	EVA1B	Q9NVM1	165 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	FBXO5	Q9UKT4	447 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	LILRA5	A6NI73	299 aa		11.61	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	OR5K4	A6NMS3	321 aa		11.61	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	IQCF5	A8MTL0	148 aa		11.61	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	PDZK1P1	A8MUH7	402 aa		11.61	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	NIPSNAP2	O75323	286 aa		11.61	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	OR56A5	P0C7T3	313 aa		11.61	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	SLC2A4	P14672	509 aa		11.61	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	GABRB3	P28472	473 aa		11.61	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	PDHA2	P29803	388 aa		11.61	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	CCR7	P32248	378 aa		11.61	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	CSF2RB	P32927	897 aa		11.61	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	PREP	P48147	710 aa		11.61	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	GPX6	P59796	221 aa		11.61	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	CTBP1	Q13363	440 aa		11.61	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	HSP90AA5P	Q58FG0	334 aa		11.61	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		11.61	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		11.61	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	GALNT7	Q86SF2	657 aa		11.61	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	PDZD3	Q86UT5	571 aa		11.61	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	ZNF761	Q86XN6	746 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	VRK3	Q8IV63	474 aa		11.61	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	CHCHD4	Q8N4Q1	142 aa		11.61	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	SPDYE1	Q8NFV5	336 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55

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