RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567690.5

CCNDBP1-212, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 936 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-212ENST00000567690 ATG14Q6ZNE5 492 aa7.03□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 AMZ2Q86W34 360 aa7.03□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 ESX1Q8N693 406 aa7.03□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 ACRBPQ8NEB7 543 aa7.03□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 OR4K2Q8NGD2 314 aa7.03□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 OR13C4Q8NGS5 318 aa7.03□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 KIF18AQ8NI77 898 aa7.03□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCDC110Q8TBZ0 833 aa7.03□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 ACTL9Q8TC94 416 aa7.03□□□□□ -1.28
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CCNDBP1-212ENST00000567690 C12orf66Q96MD2 445 aa7.03□□□□□ -1.28
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CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC25A18Q9H1K4 315 aa7.03□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 EPB41L1Q9H4G0 881 aa7.03□□□□□ -1.28
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CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
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CCNDBP1-212ENST00000567690 CROTQ9UKG9 612 aa7.03□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP7.03□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa7.03□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 DUSP10Q9Y6W6 482 aa7.03□□□□□ -1.28
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CCNDBP1-212ENST00000567690 CDC14CA4D256 554 aa7.02□□□□□ -1.29
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CCNDBP1-212ENST00000567690 HACD1B0YJ81 288 aa7.02□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 ANXA9O76027 345 aa7.02□□□□□ -1.29
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CCNDBP1-212ENST00000567690 TIAF1O95411 115 aa7.02□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC35G4P0C7Q5 338 aa7.02□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 EBLN1P0CF75 366 aa7.02□□□□□ -1.29
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CCNDBP1-212ENST00000567690 RBP3P10745 1247 aa7.02□□□□□ -1.29
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CCNDBP1-212ENST00000567690 ARL4DP49703 201 aa7.02□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 KCNC4Q03721 635 aa7.02□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 TLE1Q04724 770 aa7.02□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 ABHD18Q0P651 414 aa7.02□□□□□ -1.29
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CCNDBP1-212ENST00000567690 SEPT6Q14141 434 aa7.02□□□□□ -1.29
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CCNDBP1-212ENST00000567690 WASH2PQ6VEQ5 465 aa7.02□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 PRSS42Q7Z5A4 293 aa7.02□□□□□ -1.29
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CCNDBP1-212ENST00000567690 SPRY4Q9C004 299 aa7.02□□□□□ -1.29
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CCNDBP1-212ENST00000567690 ASB8Q9H765 288 aa7.02□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 UCK1Q9HA47 277 aa7.02□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 WASH6PQ9NQA3 447 aa7.02□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 CRLS1Q9UJA2 301 aa7.02□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 TRHDEQ9UKU6 1024 aa7.02□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 HECTD1Q9ULT8 2610 aa7.01□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 OR6C74A6NCV1 312 aa7.01□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 C2orf81A6NN90 581 aa7.01□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 TERTO14746 1132 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
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