RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559948.5

PSMA4-216, Transcript of proteasome subunit alpha 4, humanhuman

TSL 5

Gene PSMA4, Length 710 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4-216ENST00000559948 ZNF398Q8TD17 642 aa8.6□□□□□ -1.03
PSMA4-216ENST00000559948 CT55Q8WUE5 264 aa8.6□□□□□ -1.03
PSMA4-216ENST00000559948 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
PSMA4-216ENST00000559948 UBXN4Q92575 508 aa8.6□□□□□ -1.03
PSMA4-216ENST00000559948 CXorf40BQ96DE9 158 aa8.6□□□□□ -1.03
PSMA4-216ENST00000559948 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa8.6□□□□□ -1.03
PSMA4-216ENST00000559948 TRIM55Q9BYV6 548 aa8.6□□□□□ -1.03
PSMA4-216ENST00000559948 SMOXQ9NWM0 555 aa8.6□□□□□ -1.03
PSMA4-216ENST00000559948 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
PSMA4-216ENST00000559948 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP8.6□□□□□ -1.03
PSMA4-216ENST00000559948 KCND3Q9UK17 655 aa8.6□□□□□ -1.03
PSMA4-216ENST00000559948 INTUQ9ULD6 942 aa8.6□□□□□ -1.03
PSMA4-216ENST00000559948 PSMD13Q9UNM6 376 aa8.6□□□□□ -1.03
PSMA4-216ENST00000559948 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa8.6□□□□□ -1.03
PSMA4-216ENST00000559948 LRRK2Q5S007 2527 aa8.6□□□□□ -1.03
PSMA4-216ENST00000559948 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
PSMA4-216ENST00000559948 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
PSMA4-216ENST00000559948 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
PSMA4-216ENST00000559948 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa8.59□□□□□ -1.03
PSMA4-216ENST00000559948 OR5K3A6NET4 321 aa8.59□□□□□ -1.03
PSMA4-216ENST00000559948 MGAT4DA6NG13 374 aa8.59□□□□□ -1.03
PSMA4-216ENST00000559948 OR2AG2A6NM03 316 aa8.59□□□□□ -1.03
PSMA4-216ENST00000559948 C21orf140B9A014 251 aa8.59□□□□□ -1.03
PSMA4-216ENST00000559948 MKRN2OSH3BPM6 223 aa8.59□□□□□ -1.03
PSMA4-216ENST00000559948 DNAJB5O75953 348 aa8.59□□□□□ -1.03
PSMA4-216ENST00000559948 AGTP01019 485 aa8.59□□□□□ -1.03
PSMA4-216ENST00000559948 MT-ND3P03897 115 aa8.59□□□□□ -1.03
PSMA4-216ENST00000559948 KRT1P04264 644 aa8.59□□□□□ -1.03
PSMA4-216ENST00000559948 EBLN1P0CF75 366 aa8.59□□□□□ -1.03
PSMA4-216ENST00000559948 VCLP18206 1134 aa8.59□□□□□ -1.03
PSMA4-216ENST00000559948 ADRA1AP35348 466 aa8.59□□□□□ -1.03
PSMA4-216ENST00000559948 HALP42357 657 aa8.59□□□□□ -1.03
PSMA4-216ENST00000559948 PMS2P54278 862 aa8.59□□□□□ -1.03
PSMA4-216ENST00000559948 HADHBP55084 474 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PSMA4-216ENST00000559948 HSD11B2P80365 405 aa8.59□□□□□ -1.03
PSMA4-216ENST00000559948 XIAPP98170 497 aa8.59□□□□□ -1.03
PSMA4-216ENST00000559948 TUBB3Q13509 450 aa8.59□□□□□ -1.03
PSMA4-216ENST00000559948 TFDP2Q14188 446 aa8.59□□□□□ -1.03
PSMA4-216ENST00000559948 LCN10Q6JVE6 187 aa8.59□□□□□ -1.03
PSMA4-216ENST00000559948 FAM151BQ6UXP7 276 aa8.59□□□□□ -1.03
PSMA4-216ENST00000559948 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa8.59□□□□□ -1.03
PSMA4-216ENST00000559948 ASB18Q6ZVZ8 466 aa8.59□□□□□ -1.03
PSMA4-216ENST00000559948 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PSMA4-216ENST00000559948 KMT5CQ86Y97 462 aa8.59□□□□□ -1.03
PSMA4-216ENST00000559948 VSTM4Q8IW00 320 aa8.59□□□□□ -1.03
PSMA4-216ENST00000559948 D2HGDHQ8N465 521 aa8.59□□□□□ -1.03
PSMA4-216ENST00000559948 TEX19Q8NA77 164 aa8.59□□□□□ -1.03
PSMA4-216ENST00000559948 OR2L2Q8NH16 312 aa8.59□□□□□ -1.03
PSMA4-216ENST00000559948 GDAP1Q8TB36 358 aa8.59□□□□□ -1.03
PSMA4-216ENST00000559948 NAT14Q8WUY8 206 aa8.59□□□□□ -1.03
PSMA4-216ENST00000559948 ZFPM2Q8WW38 1151 aa8.59□□□□□ -1.03
PSMA4-216ENST00000559948 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
PSMA4-216ENST00000559948 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
PSMA4-216ENST00000559948 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
PSMA4-216ENST00000559948 CCDC42Q96M95 316 aa8.59□□□□□ -1.03
PSMA4-216ENST00000559948 PPM1MQ96MI6 270 aa8.59□□□□□ -1.03
PSMA4-216ENST00000559948 TTC25Q96NG3 672 aa8.59□□□□□ -1.03
PSMA4-216ENST00000559948 VAT1Q99536 393 aa8.59□□□□□ -1.03
PSMA4-216ENST00000559948 GPR87Q9BY21 358 aa8.59□□□□□ -1.03
PSMA4-216ENST00000559948 GOLPH3Q9H4A6 298 aa8.59□□□□□ -1.03
PSMA4-216ENST00000559948 DEF6Q9H4E7 631 aa8.59□□□□□ -1.03
PSMA4-216ENST00000559948 ACTL8Q9H568 366 aa8.59□□□□□ -1.03
PSMA4-216ENST00000559948 PDE7BQ9NP56 450 aa8.59□□□□□ -1.03
PSMA4-216ENST00000559948 FGF21Q9NSA1 209 aa8.59□□□□□ -1.03
PSMA4-216ENST00000559948 HRASLS2Q9NWW9 162 aa8.59□□□□□ -1.03
PSMA4-216ENST00000559948 HACD3Q9P035 362 aa8.59□□□□□ -1.03
PSMA4-216ENST00000559948 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa8.59□□□□□ -1.03
PSMA4-216ENST00000559948 RARRES3Q9UL19 164 aa8.59□□□□□ -1.03
PSMA4-216ENST00000559948 POLHQ9Y253 713 aa8.59□□□□□ -1.03
PSMA4-216ENST00000559948 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PSMA4-216ENST00000559948 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa8.58□□□□□ -1.04
PSMA4-216ENST00000559948 CDC14CA4D256 554 aa8.58□□□□□ -1.04
PSMA4-216ENST00000559948 MFAP3LO75121 409 aa8.58□□□□□ -1.04
PSMA4-216ENST00000559948 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP8.58□□□□□ -1.04
PSMA4-216ENST00000559948 CAPN1P07384 714 aa8.58□□□□□ -1.04
PSMA4-216ENST00000559948 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PSMA4-216ENST00000559948 TNNT1P13805 278 aa8.58□□□□□ -1.04
PSMA4-216ENST00000559948 HLA-DPA1P20036 260 aa8.58□□□□□ -1.04
PSMA4-216ENST00000559948 PTPN4P29074 926 aa8.58□□□□□ -1.04
PSMA4-216ENST00000559948 MARCKSL1P49006 195 aa8.58□□□□□ -1.04
PSMA4-216ENST00000559948 RPS18P62269 152 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PSMA4-216ENST00000559948 ACY1Q03154 408 aa8.58□□□□□ -1.04
PSMA4-216ENST00000559948 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PSMA4-216ENST00000559948 GPS2Q13227 327 aa8.58□□□□□ -1.04
PSMA4-216ENST00000559948 MPP3Q13368 585 aa8.58□□□□□ -1.04
PSMA4-216ENST00000559948 OLIG2Q13516 323 aa8.58□□□□□ -1.04
PSMA4-216ENST00000559948 ITGA9Q13797 1035 aa8.58□□□□□ -1.04
PSMA4-216ENST00000559948 GTF2H3Q13889 308 aa8.58□□□□□ -1.04
PSMA4-216ENST00000559948 TRIM14Q14142 442 aa8.58□□□□□ -1.04
PSMA4-216ENST00000559948 PPP2R5EQ16537 467 aa8.58□□□□□ -1.04
PSMA4-216ENST00000559948 UGT8Q16880 541 aa8.58□□□□□ -1.04
PSMA4-216ENST00000559948 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PSMA4-216ENST00000559948 ZNF789Q5FWF6 425 aa8.58□□□□□ -1.04
PSMA4-216ENST00000559948 TFDP3Q5H9I0 405 aa8.58□□□□□ -1.04
PSMA4-216ENST00000559948 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa8.58□□□□□ -1.04
PSMA4-216ENST00000559948 FNBP1LQ5T0N5 605 aa8.58□□□□□ -1.04
PSMA4-216ENST00000559948 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa8.58□□□□□ -1.04
PSMA4-216ENST00000559948 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PSMA4-216ENST00000559948 KAZNQ674X7 775 aa8.58□□□□□ -1.04
PSMA4-216ENST00000559948 KLHL35Q6PF15 583 aa8.58□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.5 ms