RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556787.5

PAPOLA-222, Transcript of poly(A) polymerase alpha, human

TSL 2

Gene PAPOLA, Length 806 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PAPOLA-222	ENST00000556787	CALML4	Q96GE6	196 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	HGH1	Q9BTY7	390 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	MIOS	Q9NXC5	875 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	PRSS47	A8MTI9	375 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	DOK2	O60496	412 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	FGF5	P12034	268 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	PSMC4	P43686	418 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	LMAN1	P49257	510 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	HSD17B4	P51659	736 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	CREB5	Q02930	508 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	GCNT6	Q5T4J0	391 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	TMEM198	Q66K66	360 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	MEX3B	Q6ZN04	569 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	GALNT13	Q8IUC8	556 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	CEP97	Q8IW35	865 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	ALG14	Q96F25	216 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	GFI1	Q99684	422 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	TMEM5	Q9Y2B1	443 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	ELOVL7	A1L3X0	281 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	BLOC1S5-TXNDC5	H3BN57	136 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	PLK4	O00444	970 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	CTDSP2	O14595	271 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	TSPAN1	O60635	241 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	CKMT2	P17540	419 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	GCH1	P30793	250 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	SLC15A1	P46059	708 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	EPS8	Q12929	822 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	CUL4A	Q13619	759 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	ADAM5	Q6NVV9	412 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	C17orf77	Q96MU5	243 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	MAF1	Q9H063	256 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	CCDC68	Q9H2F9	335 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	HHATL	Q9HCP6	504 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	TAS2R14	Q9NYV8	317 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787		A0A087WYN8	130 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	AVIL	O75366	819 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	TUBB	P07437	444 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	CSH1	P0DML2	217 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	CSH2	P0DML3	217 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	MSH3	P20585	1137 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	NMBR	P28336	390 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	GARS	P41250	739 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	SNX16	P57768	344 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	TUBB4B	P68371	445 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	SIRPA	P78324	504 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	TMF1	P82094	1093 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	RUNX1T1	Q06455	604 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	MFAP5	Q13361	173 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	NTRK2	Q16620	822 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	RAB6C	Q53S08	254 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	DHRS7B	Q6IAN0	325 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	DGLUCY	Q7Z3D6	616 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	POC5	Q8NA72	575 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	NSL1	Q96IY1	281 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	FAM81B	Q96LP2	452 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	F2RL3	Q96RI0	385 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	RAB6C	Q9H0N0	254 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	GHITM	Q9H3K2	345 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	HACL1	Q9UJ83	578 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	SLC7A7	Q9UM01	511 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787		A0A1W2PQ09	198 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	DUXA	A6NLW8	204 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	SSX4	O60224	188 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	CIDEA	O60543	219 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	PRAMEF11	O60813	436 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	PLA2G4B	P0C869	781 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	MMP9	P14780	707 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	EPHA2	P29317	976 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	HOXD13	P35453	343 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PAPOLA-222	ENST00000556787	TIMP3	P35625	211 aa		4.59	□□□□□ -1.67

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