RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555124.1

LRP1-208, Transcript of LDL receptor related protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene LRP1, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1-208ENST00000555124 ZNF449Q6P9G9 518 aa14.53□□□□□ -0.08
LRP1-208ENST00000555124 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa14.53□□□□□ -0.08
LRP1-208ENST00000555124 TMPRSS12Q86WS5 348 aa14.53□□□□□ -0.08
LRP1-208ENST00000555124 CCNJLQ8IV13 435 aa14.53□□□□□ -0.08
LRP1-208ENST00000555124 IGDCC3Q8IVU1 814 aa14.53□□□□□ -0.08
LRP1-208ENST00000555124 TRIM48Q8IWZ4 208 aa14.53□□□□□ -0.08
LRP1-208ENST00000555124 CEP112Q8N8E3 955 aa14.53□□□□□ -0.08
LRP1-208ENST00000555124 AVL9Q8NBF6 648 aa14.53□□□□□ -0.08
LRP1-208ENST00000555124 WDR48Q8TAF3 677 aa14.53□□□□□ -0.08
LRP1-208ENST00000555124 TCF12Q99081 682 aa14.53□□□□□ -0.08
LRP1-208ENST00000555124 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
LRP1-208ENST00000555124 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
LRP1-208ENST00000555124 GRHL1Q9NZI5 618 aa14.53□□□□□ -0.08
LRP1-208ENST00000555124 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa14.53□□□□□ -0.08
LRP1-208ENST00000555124 CPNE7Q9UBL6 633 aa14.53□□□□□ -0.08
LRP1-208ENST00000555124 PSMD13Q9UNM6 376 aa14.53□□□□□ -0.08
LRP1-208ENST00000555124 CHMP2BQ9UQN3 213 aa14.53□□□□□ -0.08
LRP1-208ENST00000555124 WDR37Q9Y2I8 494 aa14.53□□□□□ -0.08
LRP1-208ENST00000555124 NCOR2Q9Y618 2525 aa14.53□□□□□ -0.08
LRP1-208ENST00000555124 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 MT-CO3P00414 261 aa14.52□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 VIPP01282 170 aa14.52□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 SPINK2P20155 84 aa14.52□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 ALDH4A1P30038 563 aa14.52□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 SLC19A1P41440 591 aa14.52□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 GPR3P46089 330 aa14.52□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 PLTPP55058 493 aa14.52□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 CLDN6P56747 220 aa14.52□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 FOXK2Q01167 660 aa14.52□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 CAV1Q03135 178 aa14.52□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 CRYMQ14894 314 aa14.52□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 CLCA4Q14CN2 919 aa14.52□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 TYSND1Q2T9J0 566 aa14.52□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 ZNF438Q7Z4V0 828 aa14.52□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 SPRED1Q7Z699 444 aa14.52□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 CILP2Q8IUL8 1156 aa14.52□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 CALML6Q8TD86 181 aa14.52□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 ART4Q93070 314 aa14.52□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 SH3KBP1Q96B97 665 aa14.52□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 CXorf40BQ96DE9 158 aa14.52□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 CFAP36Q96G28 342 aa14.52□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 SLC38A3Q99624 504 aa14.52□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 SCNM1Q9BWG6 230 aa14.52□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 TSSK1BQ9BXA7 367 aa14.52□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 WWP1Q9H0M0 922 aa14.52□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 LRRN3Q9H3W5 708 aa14.52□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 COG4Q9H9E3 785 aa14.52□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 WASF3Q9UPY6 502 aa14.52□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 TEX264Q9Y6I9 313 aa14.52□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 FAM149AA5PLN7 773 aa14.51□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 OR52A4PA6NMU1 304 aa14.51□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 E7ESA3 106 aa14.51□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 B4GAT1O43505 415 aa14.51□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 SLC35G4P0C7Q5 338 aa14.51□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP14.51□□□□□ -0.096e-8■□□□□ 11
LRP1-208ENST00000555124 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 OR1D5P58170 312 aa14.51□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 SPIDRQ14159 915 aa14.51□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 NR1D2Q14995 579 aa14.51□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 TRADDQ15628 312 aa14.51□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 CDCP2Q5VXM1 449 aa14.51□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 ZNF470Q6ECI4 717 aa14.51□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 CENPUQ71F23 418 aa14.51□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 KCNMB4Q86W47 210 aa14.51□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 LRRC6Q86X45 466 aa14.51□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 ANKMY2Q8IV38 441 aa14.51□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 LMNTD2Q8IXW0 634 aa14.51□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 ELMO1Q92556 727 aa14.51□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 FAM167BQ9BTA0 163 aa14.51□□□□□ -0.09
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LRP1-208ENST00000555124 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 KCNK4Q9NYG8 393 aa14.51□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 GNPTGQ9UJJ9 305 aa14.51□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 KLK13Q9UKR3 277 aa14.51□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa14.51□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 CLCA2Q9UQC9 943 aa14.51□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa14.51□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 A0A1W2PQM1 296 aa14.5□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 CASC3O15234 703 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP14.5□□□□□ -0.096e-8■□□□□ 9.5
LRP1-208ENST00000555124 TCEA3O75764 348 aa14.5□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 S1PR4O95977 384 aa14.5□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 ITGB6P18564 788 aa14.5□□□□□ -0.09
LRP1-208ENST00000555124 FMO4P31512 558 aa14.5□□□□□ -0.09
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