RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 IRAK2O43187 625 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 TPBGLP0DKB5 382 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 ITIH2P19823 946 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 AMPD1P23109 780 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 MASP1P48740 699 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 RAB5CP51148 216 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 HK2P52789 917 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
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PTPRB-210ENST00000551525 SLC18A3Q16572 532 aa6.24□□□□□ -1.41
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PTPRB-210ENST00000551525 FBXL6Q8N531 539 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC185Q8N715 623 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 SPATA4Q8NEY3 305 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 HUS1BQ8NHY5 278 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 RIT1Q92963 219 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
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PTPRB-210ENST00000551525 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 DCTN4Q9UJW0 460 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 RPS6KA6Q9UK32 745 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 A0A087WWV3 80 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa6.24□□□□□ -1.41
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PTPRB-210ENST00000551525 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
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PTPRB-210ENST00000551525 LRRC14Q15048 493 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 SPDYE7PQ495Y7 208 aa6.24□□□□□ -1.41
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PTPRB-210ENST00000551525 NLRC3Q7RTR2 1065 aa6.24□□□□□ -1.41
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PTPRB-210ENST00000551525 EXTL2Q9UBQ6 330 aa6.24□□□□□ -1.41
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PTPRB-210ENST00000551525 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa6.24□□□□□ -1.41
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PTPRB-210ENST00000551525 K7ERQ8 282 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 MEIS2O14770 477 aa6.24□□□□□ -1.41
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PTPRB-210ENST00000551525 PROZP22891 400 aa6.24□□□□□ -1.41
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PTPRB-210ENST00000551525 CBWD2Q8IUF1 395 aa6.24□□□□□ -1.41
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PTPRB-210ENST00000551525 OR5H6Q8NGV6 325 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 FAM172AQ8WUF8 416 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 CKAP2Q8WWK9 683 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 ISCUQ9H1K1 167 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 RGS18Q9NS28 235 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 GRHL1Q9NZI5 618 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 ANKMY1Q9P2S6 941 aa6.24□□□□□ -1.41
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