RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 FBN2P35556 2912 aa5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 ITPR3Q14573 2671 aa5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 RP1P56715 2156 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 A0A1W2PQM1 296 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 OR2AG2A6NM03 316 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 CDRT15L2A8MXV6 281 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 B8ZZF3 427 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 F5H423 210 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 H3BMM5 538 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 ERVH48-1M5A8F1 160 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 SMAPO00193 183 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 CES2O00748 559 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 PPM1DO15297 605 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 KLK10O43240 276 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 UGT1A9O60656 530 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 SUN1O94901 812 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 CD63P08962 238 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 ANKRD34CP0C6C1 535 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 CCNYL3P0C7X3 344 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 LIPCP11150 499 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 MYF5P13349 255 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 TCP1P17987 556 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 UGT1A6P19224 532 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 UGT1A1P22309 533 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 UGT1A4P22310 534 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 ACRV1P26436 265 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 RPL10P27635 214 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 CD1CP29017 333 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC5A2P31639 672 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 MC4RP32245 332 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 UGT1A3P35503 534 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 PAFAH1B1P43034 410 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 CAPZBP47756 277 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 MAPK10P53779 464 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 RIPPLY3P57055 190 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 ACY1Q03154 408 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 SEMA5AQ13591 1074 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 SNX1Q13596 522 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 IL11RAQ14626 422 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 POU6F1Q14863 301 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 NAA25Q14CX7 972 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 PCID2Q5JVF3 399 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 COLEC12Q5KU26 742 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 SNAP47Q5SQN1 464 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 METRNLQ641Q3 311 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 RFLNAQ6ZTI6 216 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 USP53Q70EK8 1073 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 OOSP2Q86WS3 158 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 LRRC6Q86X45 466 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 PELI3Q8N2H9 469 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 OTUD6BQ8N6M0 293 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 IL22RA1Q8N6P7 574 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 OR6P1Q8NGX9 317 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 OR8K5Q8NH50 307 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 HM13Q8TCT9 377 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 CALML6Q8TD86 181 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 MAGEC3Q8TD91 643 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC22A18Q96BI1 424 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 EID2BQ96D98 161 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 CCDC74BQ96LY2 380 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 FCRL4Q96PJ5 515 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 PANX3Q96QZ0 392 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 WDR24Q96S15 920 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 RANBP9Q96S59 729 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 FOXP3Q9BZS1 431 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 RAB33BQ9H082 229 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 CCDC68Q9H2F9 335 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 MVB12BQ9H7P6 319 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 UGT1A7Q9HAW7 530 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 UGT1A10Q9HAW8 530 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 UGT1A8Q9HAW9 530 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 RDH14Q9HBH5 336 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 ETNK1Q9HBU6 452 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 SYTL2Q9HCH5 934 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC40A1Q9NP59 571 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 PRDM8Q9NQV8 689 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 FBXO8Q9NRD0 319 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa5.5□□□□□ -1.53
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