RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534197.5

GNPTG-209, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunit gamma, humanhuman

TSL 3

Gene GNPTG, Length 420 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTG-209ENST00000534197 VAT1Q99536 393 aa21.54■■□□□ 1.04
GNPTG-209ENST00000534197 HEMGNQ9BXL5 484 aa21.54■■□□□ 1.04
GNPTG-209ENST00000534197 LHX9Q9NQ69 397 aa21.54■■□□□ 1.04
GNPTG-209ENST00000534197 SMOXQ9NWM0 555 aa21.54■■□□□ 1.04
GNPTG-209ENST00000534197 RSPH14Q9UHP6 348 aa21.54■■□□□ 1.04
GNPTG-209ENST00000534197 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa21.54■■□□□ 1.04
GNPTG-209ENST00000534197 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
GNPTG-209ENST00000534197 SGTAO43765 313 aa21.53■■□□□ 1.04
GNPTG-209ENST00000534197 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP21.53■■□□□ 1.04
GNPTG-209ENST00000534197 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
GNPTG-209ENST00000534197 RBL1P28749 1068 aa21.53■■□□□ 1.04
GNPTG-209ENST00000534197 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP21.53■■□□□ 1.04
GNPTG-209ENST00000534197 TUBB3Q13509 450 aa21.53■■□□□ 1.04
GNPTG-209ENST00000534197 DNASE1L3Q13609 305 aa21.53■■□□□ 1.04
GNPTG-209ENST00000534197 ITGA9Q13797 1035 aa21.53■■□□□ 1.04
GNPTG-209ENST00000534197 FNBP1LQ5T0N5 605 aa21.53■■□□□ 1.04
GNPTG-209ENST00000534197 MICALCLQ6ZW33 695 aa21.53■■□□□ 1.04
GNPTG-209ENST00000534197 RCOR2Q8IZ40 523 aa21.53■■□□□ 1.04
GNPTG-209ENST00000534197 ZNF398Q8TD17 642 aa21.53■■□□□ 1.04
GNPTG-209ENST00000534197 PPM1MQ96MI6 270 aa21.53■■□□□ 1.04
GNPTG-209ENST00000534197 FICDQ9BVA6 458 aa21.53■■□□□ 1.04
GNPTG-209ENST00000534197 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
GNPTG-209ENST00000534197 WWP1Q9H0M0 922 aa21.53■■□□□ 1.04
GNPTG-209ENST00000534197 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
GNPTG-209ENST00000534197 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP21.53■■□□□ 1.04
GNPTG-209ENST00000534197 PADI1Q9ULC6 663 aa21.53■■□□□ 1.04
GNPTG-209ENST00000534197 PKP3Q9Y446 797 aa21.53■■□□□ 1.04
GNPTG-209ENST00000534197 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa21.53■■□□□ 1.04
GNPTG-209ENST00000534197 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa21.53■■□□□ 1.04
GNPTG-209ENST00000534197 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
GNPTG-209ENST00000534197 CDC14CA4D256 554 aa21.52■■□□□ 1.04
GNPTG-209ENST00000534197 CREG1O75629 220 aa21.52■■□□□ 1.04
GNPTG-209ENST00000534197 PRAMEF1O95521 474 aa21.52■■□□□ 1.04
GNPTG-209ENST00000534197 NTRK1P04629 796 aa21.52■■□□□ 1.04
GNPTG-209ENST00000534197 MAGEA1P43355 309 aa21.52■■□□□ 1.04
GNPTG-209ENST00000534197 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
GNPTG-209ENST00000534197 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
GNPTG-209ENST00000534197 CNGA4Q8IV77 575 aa21.52■■□□□ 1.04
GNPTG-209ENST00000534197 CCDC50Q8IVM0 306 aa21.52■■□□□ 1.04
GNPTG-209ENST00000534197 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
GNPTG-209ENST00000534197 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
GNPTG-209ENST00000534197 UBXN4Q92575 508 aa21.52■■□□□ 1.04
GNPTG-209ENST00000534197 APOL2Q9BQE5 337 aa21.52■■□□□ 1.04
GNPTG-209ENST00000534197 FAM8A1Q9UBU6 413 aa21.52■■□□□ 1.04
GNPTG-209ENST00000534197 RARRES3Q9UL19 164 aa21.52■■□□□ 1.04
GNPTG-209ENST00000534197 OR5K3A6NET4 321 aa21.51■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 HACD1B0YJ81 288 aa21.51■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 STX7O15400 261 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 CCNYL3P0C7X3 344 aa21.51■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 SEPT6Q14141 434 aa21.51■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 PLCL1Q15111 1095 aa21.51■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa21.51■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 BBS12Q6ZW61 710 aa21.51■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 TC2NQ8N9U0 490 aa21.51■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 OR4K2Q8NGD2 314 aa21.51■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 FSD1LQ9BXM9 530 aa21.51■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 GBA3Q9H227 469 aa21.51■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 PDE7BQ9NP56 450 aa21.51■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 FKBPLQ9UIM3 349 aa21.51■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 KCND3Q9UK17 655 aa21.51■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 POLHQ9Y253 713 aa21.51■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 PLAAQ9Y263 795 aa21.51■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 PIPSLA2A3N6 862 aa21.5■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 MGAT4DA6NG13 374 aa21.5■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 DNAJB5O75953 348 aa21.5■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 LCA5LO95447 670 aa21.5■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 PDGFAP04085 211 aa21.5■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 MSH3P20585 1137 aa21.5■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 AKT1P31749 480 aa21.5■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 ADRA1AP35348 466 aa21.5■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 RPS18P62269 152 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 XIAPP98170 497 aa21.5■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 LAMB3Q13751 1172 aa21.5■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 RANBP10Q6VN20 620 aa21.5■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 DAAM2Q86T65 1068 aa21.5■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 C12orf66Q96MD2 445 aa21.5■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 NRTNQ99748 197 aa21.5■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 TRIM55Q9BYV6 548 aa21.5■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 TWSG1Q9GZX9 223 aa21.5■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 TSPY26PQ9H489 355 aa21.5■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 ACTL8Q9H568 366 aa21.5■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 FGF21Q9NSA1 209 aa21.5■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 HRASLS2Q9NWW9 162 aa21.5■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 TLK1Q9UKI8 766 aa21.5■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 TRHDEQ9UKU6 1024 aa21.5■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 H7C0C1 242 aa21.49■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa21.49■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 SRP72O76094 671 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 APOC2P02655 101 aa21.49■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 LPOP22079 712 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 ATP5OP48047 213 aa21.49■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 XRCC4Q13426 336 aa21.49■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 GPR19Q15760 415 aa21.49■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 LONRF2Q1L5Z9 754 aa21.49■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 TCTN3Q6NUS6 607 aa21.49■■□□□ 1.03
GNPTG-209ENST00000534197 D2HGDHQ8N465 521 aa21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms