RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521865.5

PABPC1-218, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, humanhuman

TSL 2

Gene PABPC1, Length 628 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1-218ENST00000521865 MPP3Q13368 585 aa20.39■□□□□ 0.85
PABPC1-218ENST00000521865 TFDP3Q5H9I0 405 aa20.39■□□□□ 0.85
PABPC1-218ENST00000521865 TCTN3Q6NUS6 607 aa20.39■□□□□ 0.85
PABPC1-218ENST00000521865 ARMC6Q6NXE6 501 aa20.39■□□□□ 0.85
PABPC1-218ENST00000521865 ASB18Q6ZVZ8 466 aa20.39■□□□□ 0.85
PABPC1-218ENST00000521865 SLC41A2Q96JW4 573 aa20.39■□□□□ 0.85
PABPC1-218ENST00000521865 HRASLS2Q9NWW9 162 aa20.39■□□□□ 0.85
PABPC1-218ENST00000521865 ANKMY1Q9P2S6 941 aa20.39■□□□□ 0.85
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PABPC1-218ENST00000521865 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa20.39■□□□□ 0.85
PABPC1-218ENST00000521865 C21orf140B9A014 251 aa20.38■□□□□ 0.85
PABPC1-218ENST00000521865 K7EM74 188 aa20.38■□□□□ 0.85
PABPC1-218ENST00000521865 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP20.38■□□□□ 0.85
PABPC1-218ENST00000521865 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
PABPC1-218ENST00000521865 PDE1BQ01064 536 aa20.38■□□□□ 0.85
PABPC1-218ENST00000521865 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP20.38■□□□□ 0.85
PABPC1-218ENST00000521865 ADCY2Q08462 1091 aa20.38■□□□□ 0.85
PABPC1-218ENST00000521865 TAZQ16635 292 aa20.38■□□□□ 0.85
PABPC1-218ENST00000521865 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
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PABPC1-218ENST00000521865 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
PABPC1-218ENST00000521865 C12orf66Q96MD2 445 aa20.38■□□□□ 0.85
PABPC1-218ENST00000521865 WWP1Q9H0M0 922 aa20.38■□□□□ 0.85
PABPC1-218ENST00000521865 GOLPH3Q9H4A6 298 aa20.38■□□□□ 0.85
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PABPC1-218ENST00000521865 FGF21Q9NSA1 209 aa20.38■□□□□ 0.85
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PABPC1-218ENST00000521865 TLCD2A6NGC4 264 aa20.37■□□□□ 0.85
PABPC1-218ENST00000521865 PRAMEF1O95521 474 aa20.37■□□□□ 0.85
PABPC1-218ENST00000521865 CA5AP35218 305 aa20.37■□□□□ 0.85
PABPC1-218ENST00000521865 PMS2P54278 862 aa20.37■□□□□ 0.85
PABPC1-218ENST00000521865 KRT33BQ14525 404 aa20.37■□□□□ 0.85
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PABPC1-218ENST00000521865 CCDC181Q5TID7 509 aa20.37■□□□□ 0.85
PABPC1-218ENST00000521865 METRNLQ641Q3 311 aa20.37■□□□□ 0.85
PABPC1-218ENST00000521865 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
PABPC1-218ENST00000521865 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
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PABPC1-218ENST00000521865 KMT5CQ86Y97 462 aa20.37■□□□□ 0.85
PABPC1-218ENST00000521865 CNGA4Q8IV77 575 aa20.37■□□□□ 0.85
PABPC1-218ENST00000521865 FCRL4Q96PJ5 515 aa20.37■□□□□ 0.85
PABPC1-218ENST00000521865 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP20.37■□□□□ 0.85
PABPC1-218ENST00000521865 CD180Q99467 661 aa20.37■□□□□ 0.85
PABPC1-218ENST00000521865 FICDQ9BVA6 458 aa20.37■□□□□ 0.85
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PABPC1-218ENST00000521865 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa20.36■□□□□ 0.85
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PABPC1-218ENST00000521865 NAT14Q8WUY8 206 aa20.36■□□□□ 0.85
PABPC1-218ENST00000521865 SEC14L1Q92503 715 aa20.36■□□□□ 0.85
PABPC1-218ENST00000521865 RUFY1Q96T51 708 aa20.36■□□□□ 0.85
PABPC1-218ENST00000521865 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
PABPC1-218ENST00000521865 HEMGNQ9BXL5 484 aa20.36■□□□□ 0.85
PABPC1-218ENST00000521865 ASB8Q9H765 288 aa20.36■□□□□ 0.85
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PABPC1-218ENST00000521865 MACROD2A1Z1Q3 448 aa20.35■□□□□ 0.85
PABPC1-218ENST00000521865 MGAT4DA6NG13 374 aa20.35■□□□□ 0.85
PABPC1-218ENST00000521865 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
PABPC1-218ENST00000521865 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
PABPC1-218ENST00000521865 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
PABPC1-218ENST00000521865 SCRG1O75711 98 aa20.35■□□□□ 0.85
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PABPC1-218ENST00000521865 RECKO95980 971 aa20.35■□□□□ 0.85
PABPC1-218ENST00000521865 AGTP01019 485 aa20.35■□□□□ 0.85
PABPC1-218ENST00000521865 PTMSP20962 102 aa20.35■□□□□ 0.85
PABPC1-218ENST00000521865 LPOP22079 712 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
PABPC1-218ENST00000521865 MAGEA1P43355 309 aa20.35■□□□□ 0.85
PABPC1-218ENST00000521865 GEMP55040 296 aa20.35■□□□□ 0.85
PABPC1-218ENST00000521865 MLLT10P55197 1068 aa20.35■□□□□ 0.85
PABPC1-218ENST00000521865 RPS18P62269 152 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
PABPC1-218ENST00000521865 KATNAL2Q8IYT4 538 aa20.35■□□□□ 0.85
PABPC1-218ENST00000521865 OR4K2Q8NGD2 314 aa20.35■□□□□ 0.85
PABPC1-218ENST00000521865 MR1Q95460 341 aa20.35■□□□□ 0.85
PABPC1-218ENST00000521865 DCUN1D1Q96GG9 259 aa20.35■□□□□ 0.85
PABPC1-218ENST00000521865 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
PABPC1-218ENST00000521865 FERMT1Q9BQL6 677 aa20.35■□□□□ 0.85
PABPC1-218ENST00000521865 GPR87Q9BY21 358 aa20.35■□□□□ 0.85
PABPC1-218ENST00000521865 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
PABPC1-218ENST00000521865 ACSL5Q9ULC5 683 aa20.35■□□□□ 0.85
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