RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516272.1

RNU6-277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-277P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-277P-201ENST00000516272 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
RNU6-277P-201ENST00000516272 SAAL1Q96ER3 474 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM39BQ9GZU3 492 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-277P-201ENST00000516272 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
RNU6-277P-201ENST00000516272 CHST11Q9NPF2 352 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-277P-201ENST00000516272 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
RNU6-277P-201ENST00000516272 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
RNU6-277P-201ENST00000516272 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
RNU6-277P-201ENST00000516272 MKLN1Q9UL63 735 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-277P-201ENST00000516272 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-277P-201ENST00000516272 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
RNU6-277P-201ENST00000516272 H3BQ06 376 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
RNU6-277P-201ENST00000516272 ICAM1P05362 532 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-277P-201ENST00000516272 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP2.35□□□□□ -2.03
RNU6-277P-201ENST00000516272 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
RNU6-277P-201ENST00000516272 MAGEA11P43364 429 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-277P-201ENST00000516272 PSMC4P43686 418 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-277P-201ENST00000516272 UBE4AQ14139 1066 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-277P-201ENST00000516272 HLA-BQ31612 363 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-277P-201ENST00000516272 RAB6CQ53S08 254 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM69AQ5T7M9 428 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-277P-201ENST00000516272 Q6ZR54 194 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-277P-201ENST00000516272 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-277P-201ENST00000516272 LSMEM2Q8N112 164 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC34A3Q8N130 599 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-277P-201ENST00000516272 CRYBG2Q8N1P7 616 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC38A9Q8NBW4 561 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-277P-201ENST00000516272 RAB6CQ9H0N0 254 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-277P-201ENST00000516272 MAGIXQ9H6Y5 334 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-277P-201ENST00000516272 MIOSQ9NXC5 875 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-277P-201ENST00000516272 RNF186Q9NXI6 227 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-277P-201ENST00000516272 ERAP1Q9NZ08 941 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-277P-201ENST00000516272 FLRT3Q9NZU0 649 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-277P-201ENST00000516272 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-277P-201ENST00000516272 CAPN7Q9Y6W3 813 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-277P-201ENST00000516272 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-277P-201ENST00000516272 PLPP2O43688 288 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-277P-201ENST00000516272 H1F0P07305 194 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-277P-201ENST00000516272 HRH2P25021 359 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-277P-201ENST00000516272 LIMK2P53671 638 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-277P-201ENST00000516272 F2RL1P55085 397 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-277P-201ENST00000516272 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-277P-201ENST00000516272 CPOQ8IVL8 374 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-277P-201ENST00000516272 HACE1Q8IYU2 909 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZFAND2BQ8WV99 257 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-277P-201ENST00000516272 HERVK_113Q902F9 699 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-277P-201ENST00000516272 NSMCE3Q96MG7 304 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-277P-201ENST00000516272 USP28Q96RU2 1077 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-277P-201ENST00000516272 FUCA2Q9BTY2 467 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-277P-201ENST00000516272 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-277P-201ENST00000516272 PANK3Q9H999 370 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-277P-201ENST00000516272 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-277P-201ENST00000516272 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-277P-201ENST00000516272 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-277P-201ENST00000516272 MUTYHQ9UIF7 546 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-277P-201ENST00000516272 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-277P-201ENST00000516272 WDR37Q9Y2I8 494 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-277P-201ENST00000516272 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-277P-201ENST00000516272 A0A1W2PQM1 296 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF195O14628 629 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-277P-201ENST00000516272 ATP6V0E1O15342 81 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-277P-201ENST00000516272 GCNT3O95395 438 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-277P-201ENST00000516272 IGHV3-13P01766 116 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-277P-201ENST00000516272 ITIH1P19827 911 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-277P-201ENST00000516272 PIK3CAP42336 1068 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-277P-201ENST00000516272 HUNKP57058 714 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-277P-201ENST00000516272 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
RNU6-277P-201ENST00000516272 LGALS3BPQ08380 585 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-277P-201ENST00000516272 UBE2V1Q13404 147 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-277P-201ENST00000516272 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
RNU6-277P-201ENST00000516272 TAF12Q16514 161 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-277P-201ENST00000516272 KLC3Q6P597 504 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-277P-201ENST00000516272 CORO6Q6QEF8 472 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF554Q86TJ5 538 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-277P-201ENST00000516272 SAMD3Q8N6K7 520 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-277P-201ENST00000516272 L3MBTL4Q8NA19 623 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-277P-201ENST00000516272 GSDMBQ8TAX9 411 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-277P-201ENST00000516272 HPSE2Q8WWQ2 592 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-277P-201ENST00000516272 SMARCE1Q969G3 411 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-277P-201ENST00000516272 MYADMQ96S97 322 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-277P-201ENST00000516272 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
RNU6-277P-201ENST00000516272 ABI3Q9P2A4 366 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-277P-201ENST00000516272 FBXW11Q9UKB1 542 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-277P-201ENST00000516272 TBX20Q9UMR3 447 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-277P-201ENST00000516272 CELA1Q9UNI1 258 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-277P-201ENST00000516272 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
RNU6-277P-201ENST00000516272 OR2M5A3KFT3 312 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-277P-201ENST00000516272 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
RNU6-277P-201ENST00000516272 MAP2K7O14733 419 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-277P-201ENST00000516272 C22orf31O95567 290 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-277P-201ENST00000516272 MMP12P39900 470 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-277P-201ENST00000516272 RARSP54136 660 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
RNU6-277P-201ENST00000516272 GSDMDP57764 484 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZBED6P86452 979 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRKAA1Q13131 559 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-277P-201ENST00000516272 TAF13Q15543 124 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-277P-201ENST00000516272 DCAF10Q5QP82 559 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-277P-201ENST00000516272 CDC73Q6P1J9 531 aa2.32□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms