RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-221ENST00000511747 ANXA6P08133 673 aa26.69■■□□□ 1.86
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SH3BP2-221ENST00000511747 CDH4P55283 916 aa26.69■■□□□ 1.86
SH3BP2-221ENST00000511747 DAG1Q14118 895 aa26.69■■□□□ 1.86
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SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
SH3BP2-221ENST00000511747 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa26.69■■□□□ 1.86
SH3BP2-221ENST00000511747 TAS2R42Q7RTR8 314 aa26.69■■□□□ 1.86
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SH3BP2-221ENST00000511747 TMEM9Q9P0T7 183 aa26.68■■□□□ 1.86
SH3BP2-221ENST00000511747 OR7A17O14581 309 aa26.67■■□□□ 1.86
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SH3BP2-221ENST00000511747 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP26.67■■□□□ 1.866e-7■■■■□ 20.2
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SH3BP2-221ENST00000511747 GIPC3Q8TF64 312 aa26.65■■□□□ 1.86
SH3BP2-221ENST00000511747 FIG4Q92562 907 aa26.65■■□□□ 1.86
SH3BP2-221ENST00000511747 BORCS5Q969J3 196 aa26.65■■□□□ 1.86
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SH3BP2-221ENST00000511747 C17orf80Q9BSJ5 609 aa26.65■■□□□ 1.86
SH3BP2-221ENST00000511747 ADNPQ9H2P0 1102 aa26.65■■□□□ 1.86
SH3BP2-221ENST00000511747 IPPKQ9H8X2 491 aa26.65■■□□□ 1.86
SH3BP2-221ENST00000511747 G3V2T6 193 aa26.65■■□□□ 1.86
SH3BP2-221ENST00000511747 NOL3O60936 208 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
SH3BP2-221ENST00000511747 INHBBP09529 407 aa26.65■■□□□ 1.86
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SH3BP2-221ENST00000511747 CCNA2P20248 432 aa26.65■■□□□ 1.86
SH3BP2-221ENST00000511747 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
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